无法使用install.packages安装R-forge包

Question

R-sig-finance邮件列表中的This、question、is、asked、over、and、over、and、over，但我不认为它在堆栈溢出时被询问过。

它是这样的：

我在哪里可以获得托管在R-forge上的最新版本的package XYZ？我试图用install.packages安装它，但结果是这样的：

> install.packages("XYZ",repos="http://r-forge.r-project.org")
Warning message: package ‘XYZ’ is not available (for R version 2.15.0)

在XYZ的R-forge网站上，我看到这个包构建失败。因此，没有下载源代码的链接。有没有其他方法可以获得源代码？获得源代码后，如何将其转换为可用library("XYZ")加载的包

Answer 1

由于几个不同的原因，R-Forge可能无法构建包。可能是文档没有更新以反映代码中的最新更改。或者，可能是某些依赖项在构建时不可用。

您可以使用svn签出源代码。首先，在R-Forge网站上搜索项目并转到项目主页--例如，http://r-forge.r-project.org/projects/returnanalytics/单击http://r-forge.r-project.org/scm/?group_id=579链接转到如下所示的页面

这个页面将告诉你用来签出项目的命令。在这种情况下，您将获得

此项目的SVN存储库可以通过匿名访问使用以下命令签出。

svn checkout svn://svn.r-forge.r-project.org/svnroot/returnanalytics/

如果您使用的是Windows，则可能需要下载并安装TortoiseSVN

一旦你安装了TortoiseSVN，你可以在Windows Explorer窗口中右击并选择"SVN checkout“。在"URL of repository:“字段中，输入除了在R-Forge上找到的命令中的"svn checkout”部分之外的所有内容。在本例中，您应该输入"svn://svn.r-forge.r-project.org/svnroot/returnanalytics/".

单击确定后，项目将下载到当前目录中。

如果您使用的是类UNIX系统(或者如果在安装forge for Windows时安装了命令行客户端工具，这不是默认设置)，则可以在终端(系统终端，而不是R终端)中输入R- TortoiseSVN提供的命令

svn checkout svn://svn.r-forge.r-project.org/svnroot/returnanalytics/

这将在当前工作目录下创建一个新目录，其中包含包中的所有文件。在该目录的顶层是一个名为"pkg“的子目录。这个特定的项目(returnanalytics)包含多个包。

ls returnanalytics/pkg
#FactorAnalytics  MPO  PApages  PerformanceAnalytics  PortfolioAnalytics

但是一些R-forge项目只有一个包。例如：

svn checkout svn://svn.r-forge.r-project.org/svnroot/random/
#Checked out revision 14.
ls random/pkg
#DESCRIPTION  inst  man  NAMESPACE  R

现在您已经有了所有代码的本地副本，如果您希望能够安装该包，则必须首先构建它。

需要注意的是:由于R-Forge未能构建该包，因此很可能该包存在问题。因此，如果您只是构建它，您可能会发现有些事情并不像预期的那样工作。特别是，很可能缺少或不完整的文档。

如果您使用的是类似UNIX的系统，则可以相对容易地构建和安装该包。对于像returnanalytics这样的多包项目，如果你想安装，比如PortfolioAnalytics包，你可以这样做

R --vanilla CMD INSTALL --build returnanalytics/pkg/PortfolioAnalytics 

"PortfolioAnalytics“是包含要构建/安装的包的目录的名称。对于单包项目，您可以像这样构建和安装

R --vanilla CMD INSTALL --build random/pkg

如果您想要在Windows上构建/安装软件包，请参阅this question并遵循@JoshuaUlrich提供的two links

可以在R Installation and Administration、the R-Forge User Manual和the SVN manual中找到更多信息。

Answer 2

您尝试安装的包的当前版本也可能需要较新版本的R，例如，您可能会看到如下错误：

“错误:此R为版本2.15.0，程序包'PerformanceAnalytics‘需要R >= 3.0.0”

然后你可以试着更新你的R

或者，如果您面临与我相同的情况，正在尝试使用pqR (当前使用R版本2.15)，您可以在此处找到过期的已实现包：

http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/PerformanceAnalytics/

您可以从R-Forge packages页面->“稳定发布:从CRAN获取PerformanceAnalytics 1.4.3541”->旧源代码: PerformanceAnalytics归档中获得此处

例如，您会发现package PerformanceAnalytics version 1.1.0只需要R >= 2.14

祝好运

Answer 3

或者，如果在GitHub上有一个存储库，您可以从GitHub安装特定的包。

我运行了install.packages('ggfortify')，得到了

警告消息：“包‘ggfortify’不可用(适用于R版本3.3.2)”

ggfortify是同一个包的GitHub存储库。

devtools库允许您使用install_github('username/repo')直接从GitHub安装包。

library(devtools)
install_github('sinhrks/ggfortify')