在simpleitk中设置感兴趣区域

Question

我正试着用三维CT扫描分割肝脏肿瘤。到目前为止，我的准确率只有70%。

我的提高准确率的计划是分割出整个肝脏，并将其设置为感兴趣的区域，然后分割肝脏内部的肿瘤。然而，我遇到的问题是，我使用的任何阈值方法(邻域连接滤波器、二值阈值图像滤波器等)将分段内部的值设置为白色(255)，将分段外部的值设置为黑色(0)。

有没有一种方法可以将外部体素设置为黑色，而不接触肝脏内部的体素？我一直在通读sitk文档，但我在找到一个可以帮助我做到这一点的过滤器时遇到了麻烦。

Answer 1

首先，在SimpleITK中，大多数情况下，掩码和许多分割通常是0和0的二进制。因此，请仔细检查输出是否为0和255，您可能希望修改分割算法以将其作为输出。

你可以使用MaskImageFilter，在那里你可以设置蒙版图像中的值，使灰度图像“变黑”。

如果两个图像是相同类型的，并且遮罩图像是0和1，那么您可以简单地将图像相乘。