我正在尝试安装一个名为qiime http://qiime.org/install/install.html的程序,我已经按照说明完成了系统必备组件的安装以及构建和安装,但由于python找不到defaultdict计数器而卡住了。我在谷歌上安装了defaultdict,但我什么也没找到。如何安装defaultdict和counter?这就是我得到的错误。谢谢
casey@casey-laptop:~/Downloads/Qiime-1.5.0/tests$ cd
casey@casey-laptop:~$ align_seqs.py -h
Traceback (most recent call last):
File "/usr/local/bin/align_seqs.py", line 15, in <module>
from qiime.util import parse_command_line_parameters, get_options_lookup
File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/qiime/util.py", line 25, in <module>
from collections import defaultdict, Counter
ImportError: cannot import name Counter
casey@casey-laptop:~/Downloads/Qiime-1.5.0/tests$ python all_tests.py
Traceback (most recent call last):
File "all_tests.py", line 10, in <module>
from qiime.util import (parse_command_line_parameters, get_options_lookup,
File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/qiime/util.py", line 25, in <module>
from collections import defaultdict, Counter
ImportError: cannot import name Counter发布于 2012-06-02 17:06:46
该qiime程序似乎使用了collections模块的Counter类。然而,这是在Python2.7中引入的,而您使用的是Python2.6。
因此,将Python更新到2.7 (或者在2.6之外安装2.7 )就是解决方案。
发布于 2012-06-02 17:14:09
class collections.Counter是
2.7版中的新功能。
https://stackoverflow.com/questions/10861076
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