Linux生物信息学工具

Question

我正在寻找一个数据可视化工具，将可视化生物数据。我习惯了做一个C#和.net程序员。然而，据我所知，如果你在ubuntu中运行C#应用程序，你可能会遇到麻烦。对于在考虑这些规范的情况下使用语言，有什么建议吗？我在考虑Java，但我很乐意接受建议。

Answer 1

C#是一个可靠的选择，特别是如果您已经了解该语言的话。C#和.NET框架与Mono project有一个可靠的跨平台端口，您可以使用Gtk#绑定创建Gnome。

作为替代方案，Java被用于许多生物信息学应用程序。尽管就我个人而言，我不得不说它们中的大多数都有糟糕的用户界面，而且Java的内存管理似乎不适合处理生物信息学中常见的数据大小，- tools经常会耗尽内存或变得非常慢。这不一定是Java固有的问题，也不一定是草率编程的问题，但是Java肯定帮不上忙。

Java的替代方案也是具有合适GUI库的Python (有一些很好的库)，特别是因为Python提供了更好、更精致的语法。

如果您真的在处理大数据或者性能很重要，那么另一个值得一试的选择是使用C++和Qt来构建图形用户界面。请注意，如果您还不精通C++，这将使开发变得非常复杂。