如何计算多边形平均值并对其进行映射？

Question

我有这样的数据集(pts)：

x <- seq(-124.25,length=115,by=0.5)    
y <- seq(26.25,length=46,by=0.5)
z = 1:5290

longlat <- expand.grid(x = x, y = y)  # Create an X,Y grid
pts=data.frame(longlat,z) 
names(pts) <- c( "x","y","data")

我知道我可以通过执行以下操作将数据帧(Pts)映射到映射中：

library(sp)
library(rgdal)
library(raster)
library(maps)
coordinates(pts)=~x+y

proj4string(pts)=CRS("+init=epsg:4326") # set it to long, lat

pts = spTransform(pts,CRS(" +init=epsg:4326 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs +towgs84=0,0,0"))
pts <- as(pts, "SpatialPixelsDataFrame")
r = raster(pts)
projection(r) = CRS(" +init=epsg:4326 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs +towgs84=0,0,0")

plot(r)
map("usa",add=T)

我的问题是，我如何计算10个EPA区域的平均值并映射这些平均值？

环境保护局区域可在网页底部找到，网址为：http://www.epa.gov/wed/pages/ecoregions/level_iii_iv.htm

谢谢

Answer 1

首先读取shape文件

er <- readOGR("Eco_Level_III_US.shp", "Eco_Level_III_US")

然后确保栅格r和生态区域er具有相同的投影

er.4326 <- spTransform(er, CRS("+init=epsg:4326 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs +towgs84=0,0,0"))

从shapefile中提取r个栅格数据(这可能需要几分钟)，计算平均值并将其添加到多边形中。

er.v <- extract(r, er.4326)
means <- sapply(er.v, mean)
er.4326$means <- means

最后把它画出来

 spplot(er.4326, "means")