OpenBUGS:伯努利分布中缺少值

Question

我试图通过R (R2OpenBUGS)用OpenBUGS将观测“时间”建模为随机变量。如果所有的观察时间都可用(没有NA)，则一切正常，但如果我将其中一个时间设置为NA，则不会发生任何事情。我用WinBUGS测试了相同的代码，得到陷阱错误'NIL dereference (read)‘。所以我的问题是，我的代码中是否真的有什么错误，或者我的模型对于BUGS来说太奇怪了？

我的模型是这样的：

model{
 for(i in 1:k){
  obs[i] ~ dbern(p) #is the observation done at time 1 or 2?
  y[(i-1)*2 + obs[i]+1] <- x[i]
 }    
 for(i in 1:n){    
   y[i] ~ dnorm(mu,tau) 
 }    
 mu ~ dnorm(0,0.0001)
 tau~ dgamma(0.001,0.001)  
 p ~ dunif(0,1) 
}

R代码看起来是这样的：

library(R2OpenBUGS)
x<-obs<-rep(NA,5)
for(i in 1:k)
{
  obs[i]<-sample(c(0,1),1) #observation time of ith observation
  x[i]<-rnorm(1) #observed values
}

obs[2]<-NA #one of the sampling times is missing
INITS <- list(list(tau=1,mu=0,p=0.5))
DATA  <- list(x=x,n=n,k=k,obs=obs)

ob <- bugs(
  data=DATA,
  inits=INITS,
  parameters.to.save=c("tau","mu","p","y"),
  model.file="BUGSModel.R",
  n.chains=1,
  n.iter=50,
  n.burnin=10,
  n.thin=1,    
  DIC=FALSE)

Answer 1

如果我很好地理解你的问题，你是在问这个表达式

obs[i] ~ dbern(p)

对于Win/OpenBUGS来说很奇怪，所以它不会处理缺少的值。不，我不这么认为；bugs能够以这种方式处理缺失值，它甚至可以用后验分布来估算它们。

但我有强烈的怀疑

y[(i-1)*2 + obs[i]+1] <- x[i]

真的很奇怪！当您强制使用为空的观察obs[i]计算索引时，这可能会给bug带来问题。这真的很奇怪，你应该试着找另一种方法来做。首先，试着简化模型，跳过这个规则，我敢打赌，这个问题就会消失。