使用ggplot2进行分组的时间序列图

Question

我有一个实验，随着时间的推移，已经研究了三种不断进化的酵母种群。在离散的时间点，我们测量了它们的增长，这是响应变量。我基本上想要将酵母的生长绘制为时间序列，使用箱图来总结每个点的测量结果，并分别绘制三个种群的每个种群。基本上，看起来像这样的东西(作为一个新手，我不能发布实际的图像，所以x，y，z指的是三个重复的图像)：

|              xyz
|       x z    xyz
|  y    xyz
| xyz    y
| x z     
|
-----------------------
  t0     t1    t2

如何使用ggplot2来实现这一点？我有一种感觉，一定有一个简单而优雅的解决方案，但我找不到。

Answer 1

尝试以下代码：

require(ggplot2)

df <- data.frame(
  time = rep(seq(Sys.Date(), len = 3, by = "1 day"), 10),
  y = rep(1:3, 10, each = 3) + rnorm(30),
  group = rep(c("x", "y", "z"), 10, each = 3)
)
df$time <- factor(format(df$time, format = "%Y-%m-%d"))

p <- ggplot(df, aes(x = time, y = y, fill = group)) + geom_boxplot()
print(p)

​

​

只有在使用x = factor(time)时，ggplot(df, aes(x = factor(time), y = y, fill = group)) + geom_boxplot() + scale_x_date()才不起作用。

对于这种形式的图形，需要预处理，即factor(format(df$time, format = "%Y-%m-%d"))。