安装带外部MPI接口的spack包

Question

我正在尝试在集群中安装spack包，如果我使用

spack install namd

Spack下载并安装自己的MPI接口。因为它是一个集群，所以我想利用本机MPI界面，这是由管理员个性化的，以便在特定的计算机上快速工作。如何告知spack使用已经安装的MPI接口(即openmpi或mpich)？

顺便说一句，我对spack非常陌生。谢谢!

Answer 1

好了，我已经通过阅读spack web上的这个page找到了答案。我需要用spack config edit packages创建一个配置文件，并添加如下内容

packages:
  openmpi:
    buildable: False
    modules:
      openmpi@3.1.3%gcc@8.2.0 arch=linux-x86_64-centos7: /opt/modules/mpi/gcc/8/openmpi/3.1.3
all:                                                                                                                                                                                         
    compiler: [gcc@8.2.0]                                                                                                                                                                      
    providers:                                                                                                                                                                                 
      mpi: [openmpi@3.1.3]

实际上，为了使/opt/modules/mpi/gcc/8/openmpi/3.1.3可见，我需要先加载/opt/modules/compiladores/gcc/8，所以我需要类似这样的东西

packages:
  openmpi:
    buildable: False
    modules:
      openmpi@3.1.3%gcc@8.2.0 arch=linux-x86_64-centos7:
        - /opt/modules/compiladores/gcc/8
        - /opt/modules/mpi/gcc/8/openmpi/3.1.3

但这不起作用，因为它需要多个外部模块，并且不可能指定多个(请参阅here)。

此外，spack不使用外部模块，它通过复制和解析来创建一个内部模块。它将忽略来自原始外部模块的可能重要的模块依赖项或环境变量。还需要对modules.yaml进行正确配置，以设置或预先设置此环境变量。