有些程序不接受输入文件的进程替换吗？

Question

我试图对程序的输入文件使用进程替换，但它不起作用。是不是因为有些程序不允许进程替换输入文件？

以下代码不起作用：

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!

但以下控件确实起作用：

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]

这表明进程替换本身是有效的，但是clustalw程序本身不喜欢进程替换--可能是因为它创建了一个非标准文件，或者创建了具有不寻常文件名的文件。

程序不接受进程替换是很常见的吗？我如何检查这是否是问题所在？

我在Ubuntu9.10上运行GNU bash version4.0.33(1)-release (x86_64-pc-linux-gnu)。Clustalw的版本是2.0.10。

Answer 1

是。我在其他程序中也注意到了同样的事情。例如，它在emacs中也不起作用。它给出“文件已存在，但无法读取”。这绝对是一个特殊的文件，对我来说，/proc/self/fd/some_number。而且在默认设置下，它在less和most上都不能可靠地工作。

对于大多数人来说：

most <(/bin/echo 'abcdef')

而shorter则不显示任何内容。较长的值会截断开头。less显然是有效的，但前提是您指定了-f。

我发现zsh的=在实践中更有用。除了用<代替=之外，它在语法上是一样的。但它只创建了一个临时文件，所以支持不依赖于程序。

编辑：

我发现zsh使用TMPPREFIX来选择临时文件名。因此，即使您不希望真正的/tmp是tmpfs，您也可以为zsh挂载一个。

Answer 2

进程替换将创建一个命名管道。您不能搜索命名管道。