blocks|key|1189837|text|也可以在R-Forge网站上查看光栅包：|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|data|1189838|http://r-forge.r-project.org/projects/raster/|offset|length|1189839|它还没有发布到CRAN，但它是一个很好的包，可以导入、分析、提取、子集图像并将其转换为矩阵)。空间分析也是可能的。|1189840|您可以通过以下方式下载R中的程序包：|1189841|install.packages("raster",repos="http://r-forge.r-project.org")
require(raster)|code-block|syntax|javascript|1189842|R的一个例子：|1189843|#from+file
r+<-+raster(system.file("external/test.grd",+package="raster"))
logo+<-+raster(system.file("external/rlogo.grd",+package="raster"),+values=TRUE)+
plot(logo)|1189844|检查|1189845|?raster+#+and+go+to+index+of+the+package+for+an+overview+of+all+the+options+for+image+analysis.|1189846|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url^0|0|0|19|0|0|0|0|0|0|0|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|13|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|B|3|C|5|6|7|14|8|@]|9|@$D|15|E|16|1|17]]|A|$]]|$1|F|3|G|5|6|7|18|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|H|3|I|5|6|7|19|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|J|3|K|5|L|7|1A|8|@]|9|@]|A|$M|N]]|$1|O|3|P|5|6|7|1B|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|Q|3|R|5|L|7|1C|8|@]|9|@]|A|$M|N]]|$1|S|3|T|5|6|7|1D|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|U|3|V|5|L|7|1E|8|@]|9|@]|A|$M|N]]|$1|W|3|-4|5|6|7|1F|8|@]|9|@]|A|$]]]|X|$Y|$5|Z|10|11|A|$12|C]]]]

Also check out the RASTER package on the R-Forge website:

<a href="http://r-forge.r-project.org/projects/raster/" rel="noreferrer">http://r-forge.r-project.org/projects/raster/</a>

It is not released to CRAN yet but it is an excellent package to import, analyse, extract, subset images and convert them to matrices). Spatial analysis is also possible.

You can download the package in R via:

<pre><code>install.packages("raster",repos="http://r-forge.r-project.org")
require(raster)
</code></pre>

An example for R:

<pre><code>#from file
r &lt;- raster(system.file("external/test.grd", package="raster"))
logo &lt;- raster(system.file("external/rlogo.grd", package="raster"), values=TRUE) 
plot(logo)
</code></pre>

Check out

<pre><code>?raster # and go to index of the package for an overview of all the options for image analysis.
</code></pre>

blocks|key|1192277|text|我要从EBImage开始-查看vignette，它演示了您提到的许多任务。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|offset|length|style|CODE|entityRanges|data|1192278|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/EBImage/inst/doc/EBImage-introduction.pdf^0|3|7|F|8|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|N|8|@$9|O|A|P|B|C]]|D|@$9|Q|A|R|1|S]]|E|$]]|$1|F|3|-4|5|6|7|T|8|@]|D|@]|E|$]]]|G|$H|$5|I|J|K|E|$L|M]]]]

I'd start with <code>EBImage</code> - check out the <a href="http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/EBImage/inst/doc/EBImage-introduction.pdf" rel="noreferrer">vignette</a> which demonstrates many of the tasks you mention.

blocks|key|4756753|text|我相信CRAN+Task+View+on+Medical+Imaging应该有东西给你。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|offset|length|data|4756754|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|http://cran.r-project.org/web/views/MedicalImaging.html^0|3|X|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|L|8|@]|9|@$A|M|B|N|1|O]]|C|$]]|$1|D|3|-4|5|6|7|P|8|@]|9|@]|C|$]]]|E|$F|$5|G|H|I|C|$J|K]]]]

I believe the <a href="http://cran.r-project.org/web/views/MedicalImaging.html" rel="nofollow">CRAN Task View on Medical Imaging</a> should have something for you.

blocks|key|1189879|text|您可能还会对Rpy感兴趣，它允许您从Python中调用R函数和使用R包。这可能会让你有自己的蛋糕(Python的图像库)和吃掉它(R的统计分析功能)。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|offset|length|data|1189880|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|http://rpy.sourceforge.net/^0|6|3|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|L|8|@]|9|@$A|M|B|N|1|O]]|C|$]]|$1|D|3|-4|5|6|7|P|8|@]|9|@]|C|$]]]|E|$F|$5|G|H|I|C|$J|K]]]]

You may also be interested in <a href="http://rpy.sourceforge.net/" rel="nofollow">Rpy</a> which allows you to call R functions and use R packages from Python. This may allow you to have your cake (Python's imaging libraries) and eat it too (R's statistical analysis capabilities).

blocks|key|1934929|text|尝试使用rgdal包。您将能够从R读取(导入)和写入(导出)+GeoTiff图像文件。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|data|1934930|马西奥·普平·梅洛|1934931|entityMap^0|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|F|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|B|3|C|5|6|7|G|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|D|3|-4|5|6|7|H|8|@]|9|@]|A|$]]]|E|$]]

Try the rgdal package. You will be able to read (import) and write (export) GeoTiff image files from/to R.

Marcio Pupin Mello

I would like to know how I would go about performing image analysis in R. My goal is to convert images into matrices (pixel-wise information), extract/quantify color, estimate the presence of shapes and compare images based on such metrics/patterns.

I am aware of relevant packages available in Python (suggestions relevant to Python are also welcome), but I am looking to accomplish these tasks in R.

Thank you for your feedback.

-Harsh

Image analysis in R

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功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符。

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我想知道如何在R中执行图像分析。我的目标是将图像转换为矩阵(像素信息)，提取/量化颜色，估计形状的存在，并基于这些度量/模式比较图像。我知道Python中提供了相关的包(也欢迎与Python相关的建议)，但我希望在R中完成这些任务。感谢您的反馈。-Harsh

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