HDF5写入线程并发

Question

HDF5是否能够单独处理多个线程，或者它是否必须进行外部同步？OpenMP示例建议使用后者。

如果是前者，那么定义要写入的数据空间的正确方式是什么？

Answer 1

任何玉米，

HDF5可以在没有外部同步的情况下处理多个线程，尽管写入仍然是串行的。您应该编译最新版本(自2011年4月5日起为1.8.6)，并使用--enable-threadsafe和-with-pthreads=/pthreads-include-path/,/pthreads-lib-path/标志运行./configure。

例如：

./configure --enable-threadsafe -with-pthreads=/usr/include,/usr/lib

关于定义用于写入的数据空间，最简单的方法是使用多维数组、排名值和H5Screate_simple函数构造一个基本的矩形超平面。我的通常遵循相同的步骤：

    //NUM = Number of spaces in this dimension
    //Create a 1 dimensional array
    hsize_t dsDim[1] = {NUM};
    //Create the 1x1xNUM data space (rank param = 1).
    hid_t dSpace = H5Screate_simple(1, dsDim, NULL);
    ...
    Create datasets using the dataspace
    ...
    //Release the data space
    H5Sclose(dSpace);

希望这能有所帮助！