windows XP上R中的多核处理-通过doMC和foreach

Question

我发布这个问题是为了请教如何在Windows XP计算机上优化R中多处理器的使用。

目前，我正在创建4个脚本(每个脚本，例如for (i in 1:100)和(i in 101:200)等)，我同时在4个不同的R会话中运行它们。这似乎占用了所有可用的cpu。

然而，我想更有效率地做这件事。一种解决方案可能是使用"doMC“和"foreach”包，但这在Windows机器上的R中是不可能的。

例如：

library("foreach")
library("strucchange")
library("doMC") # would this be possible on a windows machine?
registerDoMC(2)  # for a computer with two cores (processors)
## Nile data with one breakpoint: the annual flows drop in 1898
## because the first Ashwan dam was built
data("Nile")
plot(Nile)

## F statistics indicate one breakpoint
fs.nile <- Fstats(Nile ~ 1)
plot(fs.nile)
breakpoints(fs.nile)     # , hpc = "foreach" --> It would be great to test this.
lines(breakpoints(fs.nile))

有什么解决方案或建议吗？

Answer 1

为了完整起见，这里是对Tal的注释的请求答案，它提供了一个简单且可移植的替代方案。答案是运行

 > library(snow)
 > help(makeCluster)

并从Examples:部分的顶部运行前三行代码：

> cl <- makeCluster(c("localhost","localhost"), type = "SOCK")
> clusterApply(cl, 1:2, get("+"), 3)
[[1]]
[1] 4

[[2]]
[1] 5

> stopCluster(cl)
> .Platform$OS.type
[1] "windows"
> 

真的那么难吗？

像doSNOW和后来的foreach这样的附加软件包可以通过可移植的方式利用这一点。

Answer 2

试试doSNOW parallel后端-它在Windows上是开箱即用的。将其与雪套接字簇一起使用。

Answer 3

您可以尝试使用REvolution Computing中的doSMP。有关更多信息，请参阅此博客文章： Parallel Multicore Processing with R (on Windows)