graphviz分割错误

Question

我正在构建一个包含许多节点的图，大约3000个节点。我写了一个简单的python程序来使用graphviz，但是它给了我分割错误，我不知道为什么，如果图太大或者我错过了什么。

代码是：

#!/usr/bin/env python

# Import graphviz
import sys
sys.path.append('..')
sys.path.append('/usr/lib/graphviz')
import gv

# Import pygraph
from pygraph.classes.graph import graph
from pygraph.classes.digraph import digraph
from pygraph.algorithms.searching import breadth_first_search
from pygraph.readwrite.dot import write

# Graph creation
gr = graph()

file = open('nodes.dat', 'r')
line = file.readline()
while line:
        gr.add_nodes([line[0:-1]])
        line = file.readline()

file.close()
print 'nodes finished, beginning edges'

edges = open('edges_ok.dat', 'r')
edge = edges.readline()
while edge:
        gr.add_edge((edge.split()[0], edge.split()[1]))
        edge = edges.readline()

edges.close()
print 'edges finished'
print 'Drawing'

# Draw as PNG
dot = write(gr)
gvv = gv.readstring(dot)
gv.layout(gvv,'dot')
gv.render(gvv,'svg','graph.svg')

它会在gv.layout()调用时崩溃。

这些文件类似于:节点：

   node1
   node2
   node3

edges_ok：

   node1 node2
   node2 node3

Answer 1

我将布局类型从点改为neato，这样就解决了问题。

我搜索了一下，似乎在大图上的点布局有点问题。