PBS编程

Question

关于PBS的一些简短而愚蠢的问题：

1-我使用提交作业

qsub job_file

是否可以在作业文件中提交(子)作业？

2-我有以下脚本：

qsub job_a
qsub job_b

对于启动job_b，如果在job_a的结果完成之前就有了，那就太好了。是否有可能设置某种障碍或其他解决方法，以便在job_a完成之前不会启动job_b？

谢谢

Answer 1

第一个问题的答案：

通常，您只能从运行PBS服务器的主机提交作业，但这取决于PBS系统的设置方式。

第二个问题的答案：

您可以使用依赖项。阅读qsub文档中的-W选项。下面是一个bash脚本示例：

dependency_id=$(qsub job_a)
qsub -W depend=afterok:$dependency_id job_b

job_b将在job_a成功完成后启动。

Answer 2

是的，可以从另一个作业提交作业，尽管它有一些警告。

-Your moms的路径中必须包含客户端命令(qsub

-$USECP将尝试从运行第一个作业的节点复制文件。

提交来自其他作业的作业时要小心，因为如果您的-Be脚本调用了太多的qsubs，那么很容易使pbs_server崩溃。

您可以使用以下语法使作业b-z依赖于作业'a‘

qsub foo.sh -W depend=afterok:jobA

作业数组也可能是一个很好的解决方案。

http://docs.adaptivecomputing.com/torque/help.htm#topics/2-jobs/multiJobSubmission.htm