在ubuntu 8.10上安装R包

Question

前言:我是来linux的os x用户，请提前原谅我的无知。

我已经使用synaptic安装了R，现在我正在尝试安装软件包。

我打开R然后尝试

install.packages("some_package")

系统尝试默认为/site-library，然后告诉我它是不可写的，然后询问关于创建一个个人库？

我应该让site-library成为可写的吗？或者这里面还有其他的东西？

Answer 1

目录所有权是缺省位置；缺省情况下目录是/usr/share/local/lib/R root:staff。如果您将自己添加到staff组(最简单:通过编辑/etc/group和/etc/gshadow)，您可以在那里编写代码，并且您不需要sudo powers来安装包。这就是我要做的。

或者，执行apt-get install littler并将示例文件/usr/share/doc/littler/examples/install.r复制到/usr/local/bin并对其执行chmod 755。The you can just do sudo install.r lattice ggplot2来举两个流行的例子。

顺便说一句，Ubuntu 8.1不是一个版本。也许你的意思是8.10？考虑升级到9.10...

编辑:也可以看看this recent SO question。

Answer 2

如果您是唯一需要这些包的用户，那么最简单、最整洁的方法就是让R为您创建一个个人库。这样你就不需要弄乱由包管理系统管理的系统目录。

在Ubuntu中安装一些包的另一种方法是查找名称类似于r-cran-*的Ubuntu包。通过这种方式，您不必担心依赖关系，所有用户都可以使用这些包，并且Ubuntu包管理系统会负责更新。但是通过这种方式只有一小部分CRAN包可用，并且您可能无法获得最新版本。