添加主机后PVM终止

Question

在使用PVM 3.4.5-12 (使用apt-get时是PVM包)的Ubuntu 9.10上，程序在添加主机后终止。

laptop> pvm
pvm> add bowtie-slave
add bowtie-slave
terminated
laptop>

仅当前配置$PVM_RSH = bin/usr/ssh

我可以在没有密码的情况下通过ssh很好地进入从机，并在其上运行命令。

有什么想法吗？

提前感谢！

以下是示例日志：

笔记本电脑日志

LINUX 02/11 10:23:32 laptop (127.0.1.1:xxxxx) t80040000 3.4.5

t80040000 02/11 10:23:32准备好青华Feb 11 10:23:32 2010

t80040000 02/11 10:23:32网络输出()发送至: errno=22

t80040000 02/11 10:23:32 em=0x2c24f0

t80040000 02/11 10:23:32 49/à76/à6c/à64/à61/à

t80040000 02/11 10:23:32 netoutput() sendto:无效参数

t80040000 02/11 10:23:32 pvmbailout(0)

领结-原木

t80080000 02/11 10:23:25弓形从(xxx.x.x.xxx:xxxxx) LINUX64 3.4.5

t80080000 02/11 10:23:25准备好2010年2月11日10:23:25

t80080000 02/11 10:28:26 work() run =启动，等待主机超时

t80080000 02/11 10:28:26 pvmbailout(0)

Answer 1

我也一直在努力解决这个问题。我只是发现了一些对我来说失败的事情。

首先，我的主主机启动时使用了从属主机无法识别的node-name。也就是说，它将自己称为"foobar“，但它实际上应该是"foobar.example.com”，这样从属程序才知道如何与它交谈。您可以通过启动主控制台来指定它，如下所示：

pvm -nfoobar.example.com

我还指定了从服务器的全名。所以在控制台中：

add baz.mumble.example.com

然后我遇到了一个问题，当我添加从设备时，控制台会挂起。嘿，至少它不是停下来了！我发现这是因为从属主机上的防火墙-通信被丢弃(pvmd在设置后不通过ssh通信，它们有另一个端口可以交谈)。不幸的是，在没有防火墙的情况下运行不是该主机的选择。默认情况下，pvmd会随机选择一个端口号，这不是我想要的。显然，有一个未记录在案的环境变量PVMNETSOCKPORT，它控制它使用的端口。现在我正在进行正确的设置，这样我就可以在我的防火墙上戳到正确的漏洞。

祝好运!如果我有进一步的进展，我会尝试更新这个答案。

Answer 2

啊..。启动PVM的乐趣！我通过一个外部库InterComm使用PVM。让PVM在任何平台上都能很好地启动总是一个有趣的练习。下面是一些你可以尝试的东西：

如果可以通过rsh连接到计算节点，请设置$PVM_RSH=/path/to/rsh。否则，要通过ssh进行配置

设置passwordless SSH并手动验证它是否正常工作。

然后，创建$PVM_ROOT/ssh，其中包含如下内容：

#!/bin/sh

host=$1
shift
/usr/bin/ssh $host ". ~/.pvmprofile; $@"

一旦解决了这个问题：

设置一些环境变量(这取决于机器)：

setenv PVM_ARCH LINUX64
setenv PVM_ROOT /users/ps14/opt-intel/pvm3
setenv PVM_BIN ${PVM_ROOT}/bin

# Set the following accordingly:    
setenv PVM_RSH ${PVM_ROOT}/ssh
#setenv PVM_RSH rsh

现在，创建一个包含以下变量的".pvmprofile“文件：

rm -f ~/.pvmprofile
env | grep PVM_ > ~/.pvmprofile

创建包含唯一主机名的主机文件：

sort -k 1,1 -u ${PBS_NODEFILE} >!  pvm_hostfile

现在，启动PVM并添加节点。我喜欢这样做，作为一行代码：

printf "%s\n%s\n" conf quit|${PVM_ROOT}/lib/pvm pvm_hostfile

Answer 3

直到现在我才意识到我可以回答我自己的问题。失败的原因是由于/etc/hosts中的hosts文件。

Ubuntu将localhost设置为127.0.0.1 localhost，但是，使用PVM时，它必须使用真实的IP地址。因此，我将实际的IP地址和我的机器名放在localhost的顶部，这样PVM将首先读取该行。然后一切都正常了。我不知道为什么它从来没有给我回送错误的消息。

正如rescdsk所评论的那样，说明使用哪个来启动主控制台也同样有效，但我想偷懒，只需输入pvm即可使其工作。

我还没有解决安全问题...也许rescdsk或Pete会对安全漏洞有一些很好的建议。不过，我的主机/群集将不会连接到互联网。有什么顾虑吗？