找不到shapeit命令- GWAS阶段化的shapeit安装

Question

我想安装用于GWAS阶段化和估算的shapeit。我从Shapeit网站下载了适用于macos的Shapeit版本：

https://mathgen.stats.ox.ac.uk/genetics_software/shapeit/shapeit.html#download

我解压了这个文件，得到了shapeit可执行文件、示例文件夹和licience文件。

接下来，我在Mac中打开终端，将目录cd到shapeit文件夹，然后输入命令行作为网站指南：

shapeit -B gwas \
        -M genetic_map.txt \
        -O gwas.phased

我得到的回应是：

shapeit command not found.

我想这意味着我需要安装shapeit或者为shapeit设置一个路径。但我不知道该怎么做。我对Macos非常陌生。

有人能帮帮我吗？

Answer 1

1. 尝试./shapeit而不是shapeit，或者
2. 先运行cp shapeit /usr/local/bin，然后重试。