R:更改heatmap.2 rowname列的大小

Question

我使用了以下代码：

library("gplots")
heatmap.2(assay(vsd)[ens_union,], trace = "none", density.info = "none")

生成以下热图：

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如您所见，行标签已被截断(例如，第一个标签应该是ENSMUSG00000000088，但只显示了ENSMUSG0 )。如何调整绘图大小以包含整个标签？

Answer 1

只需添加margins参数

library("gplots")

# generate some example data
data <- as.matrix(mtcars)

# make ridiculously long names
long.names     <- paste("ENSMUSG000000000", rownames(mtcars))
rownames(data) <- long.names

# GO!
heatmap.2(data, trace = "none", density.info = "none", 
          margins = c(8, 16)) 

别忘了，如果您喜欢使用cexRow，您还可以更改字体大小