R包安装在2个不同的位置

Question

我在两个位置安装了R包ape，它们都是.libPath()的一部分

• ape 3.3版在location1
• ape 3.4版location2

中

在ape版本3.4中，有一个新函数clustalomega。我还没有加载两个包中的任何一个(使用library)

ape::clustalomega不能在我的机器上工作。我怀疑这是因为R首先考虑的是它在location1中找到的旧版本的ape。

我尝试用.libPath(rev(.libPath())颠倒libPath的顺序，但没有改变任何东西。

有没有办法确保我们优先从位置2获取软件包(我无法控制location1上安装了什么)

Answer 1

解决方案在于函数unloadNamespace。似乎当R启动时，即使它没有加载library("ape")，它仍然从它能找到的第一个lib.loc (在本例中是location1)加载包的名称空间。

因此，为了强制从另一个位置加载名称空间，我们需要这样做：

ape::clustalomega #不存在

% loadedNamespaces() #中的‘'ape’%返回TRUE

unloadNamespace(ns = 'ape') 'ape‘%in% loadedNamespaces() #返回错误的包(loadNamespace= 'ape'，lib.loc = location2)

ape::clustalomega #现在可以在上运行