如何导入tweepy

Question

如何在本地导入tweepy而不将其安装到python中。

错误：

File "/base/data/home/apps/xxxxx/6.389169466644267567/feeds.py", line 1, in <module>
    import tweepy

File "/base/data/home/apps/xxxx/6.389169466644267567/tweepy/__init__.py", line 16, in <module>
    from tweepy.auth import OAuthHandler, AppAuthHandler

 File "/base/data/home/apps/xxxxx/6.389169466644267567/tweepy/auth.py", line 9, in <module>
    from requests_oauthlib import OAuth1Session, OAuth1

ImportError: No module named requests_oauthlib  

Answer 1

ImportError: No module named requests_oauthlib  

这一行显示Python找不到Tweepy所依赖的requests-oauthlib库。您必须通过pip或本地安装此库和Tweepy的其他依赖项。

或者，您最好考虑使用virtualenv或其他工具在本地安装库。

Answer 2

假设我们有一个很长的基因组DNA片段，其中包含一个单独的致病性岛。该DNA序列可以被“分块”成多个片段，每个片段的GC含量可以单独计算。通过查看哪些片段的GC含量相对较高或较低，您将能够大致推断出致病岛所在的位置。

要开始使用，请下载以下文件，并将其放在与Python文件相同的文件夹中：

salGenomicRegion.py

接下来，在您的文件的顶部，包括一行：

from salGenomicRegion import *

这会将名为salDNA的DNA字符串导入到您的环境中。这个字符串来自沙门氏菌致病岛1周围的更大区域。

您的任务是编写一个名为gcWin(DNA,stepLen)的函数，该函数接受DNA字符串作为输入，并执行以下操作:对于长度为stepLen的每一段DNA，计算GC含量(使用现有的gcContent函数)并打印该值(使用打印而不是返回)。

例如，

假设我们的DNA字符串长度为13，stepLen为5，那么第一个区域是DNA 0:5，下一个区域是DNA 5:10，最后一个区域是DNA 10:15。请注意，由于DNA序列的长度，最后一个片段的长度可能不是stepLen，但这没问题。回想一下，如果字符串的长度为13，那么DNA10:15将简单地提供一个短片。

我们可以使用一个for循环来遍历DNA，这样在我们的循环的每次迭代之后，我们就会跳过向前的stepLen碱基。range函数的以下语法在这里很有用：

range( 0,100,10) 0，10，20，30，40，50，60，70，80，90请注意，我们给range函数的最后一个数字告诉它要使用的步长有多大。

你可以用这种方式循环DNA，依次切出stepLen大小的每个区域。对于每个切片，通过调用gcContent(DNA)计算GC含量，并将结果打印到屏幕上。

gcWin在工作中的一个示例：

print ("gcWin of the string 'ATCCGAGGTC‘with a stepLen of 2 is:")，gcWin('ATCCGAGGTC',2) 0.0 1.0 0.5 1.0 0.5您已经编写了此函数，请在steplen设置为10,000的salDNA上运行它。

根据这些结果，您认为该区域的致病岛在哪里开始和结束？将您的答案作为注释包含在文件的顶部。

def gcContent(DNA)：

'''This function calculates the proportion of bases that are G's and C's of a DNA string to be used to calculate the GC content in pathogenecity islands'''

gcCounter=0

lengthDNA=len(DNA)

for nuc in DNA:

    if nuc=='G' or nuc=='C':

        gcCounter=gcCounter+1    #increment the gcCounter

return (float(gcCounter)/lengthDNA)

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