Spatstat -比较空间模式

Question

以前从未使用过R，但在过去的几个月里一直在通过Spatstat来分析癌症组织中的细胞分布。我提取两个不同细胞群体的阳性染色细胞的xy坐标，以生成标记的ppp。通过密度图和K/G交叉函数等直观地探索数据，确定了两个细胞群体的分布在强度方面不同的一些情况。此外，在某些情况下，细胞似乎是相互排斥的，而另一些情况的特点是由两个群体共享的“热点”。然而，除了并排的图像作为插图之外，我不知道如何最好地演示这一点。有没有办法整合两个密度图或创建强度共享区域的图形？还是我错过的Spatstat中的另一个函数？

抱歉，如果这是一个愚蠢的问题，但努力进步的事情，并将非常感谢您的建议。

问候你，马特

Answer 1

在扩展spatstat的sparr包中提供了显著性测试(=两个强度的非恒定比率)。尝试使用函数tolerance。