igraph“不是图形对象”

Question

我打算使用igraph包来获取一个网络的一些统计数据。

model1 <- ug(~a:b, ~a:c:d,~b:c)
> model1
A graphNEL graph with undirected edges
Number of Nodes = 4 
Number of Edges = 5 

问题:使用函数：

cluster.distribution(model1)

返回

Error in cluster.distribution(model1) : Not a graph object.

现在，如果我应用这个函数：

degree(model1)

我得到了相同的错误：

Error in degree(model1) : Not a graph object

但是，如果我分离igraph包，我会得到：

> detach("package:igraph", unload=TRUE)
Warning message:
'igraph' namespace cannot be unloaded:
  namespace 'igraph' is imported by 'gRbase', 'gRain' so cannot be unloaded 
> degree(model1)
a b c d 
3 2 3 2

我假设问题与软件包有关，但我的R技能还不足以让我自己解决这个问题。

> search()
 [1] ".GlobalEnv"       "package:gRain"    "package:grid"    
 [4] "package:gRbase"   "package:graph"    "tools:rstudio"   
 [7] "package:stats"    "package:utils"    "package:datasets"
 [10] "package:methods"  "Autoloads"        "package:base" 

我真的对使用igraph包中的函数很感兴趣，所以请帮助我找出为什么会出现这个错误，尽管它显然是一个图形对象。

谢谢！

Answer 1

您似乎正在尝试使用graph包和igraph包。其中一个创建的对象似乎不能用于另一个的函数中。

igraph对象属于igraph类

> g=graph.full(4)
> class(g)
[1] "igraph"

而您使用ug创建的对象来自graph包，因此是一个不同的类。

我自己测试过，但是目前graph包已经从CRAN中删除了，我没有心情去从归档中去追逐它：

http://cran.r-project.org/web/packages/graph/index.html