weighted将加权邻接矩阵转换为加权边列表

Question

我有一个nxm邻接矩阵，其中(i，j)表示i和j之间的关联分数。我需要将其转换为以下格式：i j <score1>

使用R‘igraph包，并将其输出为文本文件。

我可以推导出边缘列表，但它在没有权重的情况下出现。我使用了以下代码：

library(igraph) g <- graph.adjacency(myAdjacencymatrix) get.edgelist(g)

但是，它不会显示权重。

Answer 1

library(igraph)
set.seed(1)                # for reproducible example
myAdjacencyMatrix <- matrix(runif(400),nc=20,nr=20)

g  <- graph.adjacency(myAdjacencyMatrix,weighted=TRUE)
df <- get.data.frame(g)
head(df)
#   from to    weight
# 1    1  1 0.2655087
# 2    1  2 0.9347052
# 3    1  3 0.8209463
# 4    1  4 0.9128759
# 5    1  5 0.4346595
# 6    1  6 0.6547239

需要在对graph.adjacency(...)的调用中使用weighted=TRUE，才能将权重指定给边。然后，默认情况下，get.data.frame(...)将返回具有所有边属性的边的数据框。您可以使用what=...参数来返回，例如，带有属性的顶点列表。

未来:提供一个示例，而不是强迫我们为您创建一个！