更新h5py数据集

Question

有没有人有从h5py更新hdf5数据集的想法？假设我们创建了一个数据集，如下：

import h5py
import numpy
f = h5py.File('myfile.hdf5')
dset = f.create_dataset('mydataset', data=numpy.ones((2,2),"=i4"))
new_dset_value=numpy.zeros((3,3),"=i4")

是否可以将数据集扩展为3x3数值数组？

Answer 1

您需要创建具有"extendable“属性的数据集。在最初创建数据集之后，不可能更改此设置。要做到这点，you need to use the "maxshape" keyword。maxshape元组中的None值表示该维度的大小不受限制。因此，如果f是一个HDF5文件：

dset = f.create_dataset('mydataset', (2,2), maxshape=(None,3))

创建一个大小为(2,2)的数据集，该数据集可以沿着第一个维度无限扩展，沿着第二个维度扩展到3。现在，您可以使用resize扩展数据集

dset.resize((3,3))
dset[:,:] = np.zeros((3,3),"=i4")

第一个维度可以随心所欲地增加：

dset.resize((10,3))