加载rJava时出错

Question

当我想要加载rJava时，我得到了一个错误。已安装JDK。(我在cloudera( CentOS演示VM cdh3u4)上运行R)

> library(rJava)

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: package/namespace load failed for ‘rJava’

LD_LIBRARY_PATH设置有问题吗？如果是，我如何解决这个问题？我需要rJava运行它，以便稍后安装rhdfs。

更多信息(如果需要)：

[cloudera@localhost ~]$ java -version
java version "1.6.0_31"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_31-b04)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 20.6-b01, mixed mode)

Answer 1

让rJava正常工作在很大程度上取决于您的计算机配置。下面的代码至少可以在windows平台上运行。如果这对你的平台也有帮助，你可以试着检查一下。

1. 你必须同时使用相同的32位或64位版本:r和 JDK/JRE。
2. 如果你使用的是64位版本，请确保不要将 JAVA_HOME设置为环境变量。如果设置了此变量，则无论出于何种原因，rJava都不会工作。您可以使用以下命令检查您的JAVA_HOME是否设置在R中：

Sys.getenv("JAVA_HOME")

如果您需要设置JAVA_HOME (例如，在maven或其他方面需要它)，您可以在加载rJava之前在R-session中使用以下代码将其停用：

if (Sys.getenv("JAVA_HOME")!="")
  Sys.setenv(JAVA_HOME="")
library(rJava)

在大多数情况下，这应该会起到作用。此外，这也会解决Using the rJava package on Win7 64 bit with R的问题。我借用了R: rJava package install failing中取消设置环境变量的想法。

Answer 2

对于Ubuntu，安装oracle-java (7/8)。它将位于这个位置/usr/lib/jvm，并且需要sudo访问权限。

使用以下条目创建文件/etc/ld.so.conf.d/java.conf：

/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64
/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server

(根据您的java版本，将java-8-oracle替换为java-7-oracle或java-7-openjdk-amd64 )

然后：

sudo ldconfig

重新启动RStudio，然后安装rJava包。