R中doMC和doParallel的区别

Question

关于foreach函数，doParallel和R中的doMC有什么不同？doParallel支持windows，类unix，而doMC只支持类unix。换句话说，为什么doParallel不能直接取代doMC呢？谢谢。

更新：doParallel构建在parallel之上，它本质上是multicore和snow的合并，并自动为您的系统使用适当的工具。因此，我们可以使用doParallel来支持多系统。换句话说，我们可以使用doParallel来取代doMC。

参考：http://michaeljkoontz.weebly.com/uploads/1/9/9/4/19940979/parallel.pdf

顺便说一句，registerDoParallel(ncores=3)和

cl <- makeCluster(3)
registerDoParallel(cl)

看起来registerDoParallel(ncores=3)可以自动停止集群，而第二个不会自动停止，需要stopCluster(cl)。

参考：http://cran.r-project.org/web/packages/doParallel/vignettes/gettingstartedParallel.pdf

Answer 1

doParallel包是doSNOW和doMC的合并，就像parallel是snow和multicore的合并一样。但是，尽管doParallel拥有doMC的所有功能，但革命分析公司的Rich Calaway告诉我，他们希望保留doMC，因为在某些情况下它更高效，即使doMC现在像doParallel一样使用parallel。我个人没有运行任何基准测试来确定是否以及何时存在显着差异。

我倾向于在Linux或Mac计算机上使用doMC，在Windows计算机上使用doParallel，在Linux集群上使用doMPI，但是doParallel确实可以在所有这些平台上运行。

对于不同的注册方法，如果您执行：

registerDoParallel(cores=3)

在Windows机上，它将隐式创建集群对象以供以后与clusterApplyLB一起使用，而在Linux和Mac上，不会创建或使用集群对象。内核数只需记住，并在稍后调用mclapply时用作mc.cores参数的值。

如果执行以下命令：

cl <- makeCluster(3)
registerDoParallel(cl)

然后，注册的集群对象将与clusterApplyLB一起使用，而与平台无关。您是正确的，在这种情况下，您有责任在创建集群对象后将其关闭，而隐式集群对象将自动关闭。