使用python h5py包读取hdf文件时出错

Question

我想从我从 MODIS 网站下载的hdf文件中提取数据。链接中提供了一个示例文件。我正在使用以下代码行读取hdf文件：

>>> import h5py
>>> f = h5py.File( 'MYD08_M3.A2002182.051.2008334061251.psgscs_000500751197.hdf', 'r' )

我得到的错误是：

Traceback (most recent call last):
    File "<pyshell#3>", line 1, in <module>
f = h5py.File( 'MYD08_M3.A2002182.051.2008334061251.psgscs_000500751197.hdf', 'r' )
    File "C:\Python27\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py", line 165, in __init__
fid = make_fid(name, mode, userblock_size, fapl)
    File "C:\Python27\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py", line 57, in make_fid
fid = h5f.open(name, h5f.ACC_RDONLY, fapl=fapl)
    File "h5f.pyx", line 70, in h5py.h5f.open (h5py\h5f.c:1640)
IOError: unable to open file (File accessability: Unable to open file)

我已经尝试了其他几个来自不同来源的hdf文件，但我得到了相同的错误。这里的故障似乎是什么？

Answer 1

我认为可能有两个问题：

1)由于文件扩展名为hdf，可能这是一个HDF4文件。HDF5文件通常具有".hdf5“或".h5·”扩展名。我不确定h5py是否能够读取HDF4文件。

2)也许您必须更改文件本身的权限。如果您使用的是linux机器，请尝试：chmod +r file.hdf

您可以尝试使用HDFView打开您的文件。此软件可在多个平台上使用。你可以用它很容易地检查文件的属性。

Answer 2

这听起来像是文件权限错误，甚至是文件存在。也许可以添加一些检查，例如

import os

hdf_file = 'MYD08_M3.A2002182.051.2008334061251.psgscs_000500751197.hdf'

if not os.path.isfile(hdf_file):
    print 'file %s not found' % hdf_file

if not os.access(hdf_file, os.R_OK):
    print 'file %s not readable' % hdf_file

f = h5py.File(hdf_file, 'r')

Answer 3

我也遇到了同样的问题，后来我发现我的文件只有“只读”，出于某种原因，它会阻止h5py读取它。将权限修改为"write“后，我可以读取它。不知道为什么会这样设置。