为ggplot中的不同列值并排放置的多个框图

Question

我读过不同的帖子，比如this和this，但我的问题有一个很小的变化。我有一个这样的df

ID <- c("DJ45","DJ46","DJ47","DJ48","DJ49","DJ53","DJ54","DJ55","DJ56","DJ57")
Tool <- c("Tool_A", "Tool_A", "Tool_A", "Tool_A", "Tool_A", "Tool_B", "Tool_B", "Tool_B", "Tool_B", "Tool_B")
Name <- c("CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP", "CMP")
MS1 <- c(51,55,50,59,50,47,48,42,43,46)
MS2 <- c(13,11,14,11,10,17,18,17,20,21)
MS3 <- c(2,3,2,5,6,4,9,6,4,4)
MS4 <- c(16,13,14,11,16,16,18,16,19,15)
MS5 <- c(3,6,3,6,3,4,4,8,5,4)
MS6 <- c(7,7,5,5,8,9,8,6,6,9)

df1 <- data.frame(ID,Tool,Name,MS1,MS2,MS3,MS4,MS5,MS6)

我试图找出工具(Tool_A和Tool_B)在不同测量步骤上的统计差异，因此我做了一个t检验。

t.test(MS1 ~ Tool, df1)

为了实现可视化，我使用ggplot绘制了boxplot，但在这里我只完成了其中的一个步骤。

p <- ggplot(df1, aes(factor(Tool), MS6))
p + geom_boxplot(aes(fill = Tool)) + labs(title = "CMP")

我想通过将所有6个测量步骤的框图并排放置在一个通用标题(CMP)下包装所有内容。facet_wrap能做到这一点吗？我就是不能把它弄对。请提供建议。

Answer 1

你的问题是你需要一个很长的格式来做facet_wraps。

#first, reshape to long
library(reshape2)

df1_long <- melt(df1, id.vars=c("ID","Tool","Name"))

#then plot
p2 <- ggplot(df1_long, aes(x=factor(Tool),y=value,fill=factor(Tool)))+
  geom_boxplot() + labs(title="CMP") +facet_wrap(~variable)
p2

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Answer 2

您也可以在没有facet_wrap的情况下完成，如下所示：

library(reshape2)

df2<-melt(df1,id.var=c("ID","Tool","Name"))

p <- ggplot(df2, aes(variable, value,fill=Tool))
p + geom_boxplot() + labs(title = "CMP")

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Answer 3

您还可以使用Tidyr包中的gather函数对数据进行整形：

library(tidyr)

df1 %>% 
  gather(MS, value, MS1, MS2, MS3, MS4, MS5, MS6) %>% 
  ggplot(aes(x = factor(Tool), y = value, fill = factor(Tool)))+
  geom_boxplot()+
  facet_wrap(~MS)

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