用密度曲线覆盖直方图

Question

我正在尝试制作一个密度值的直方图，并将其与密度函数(而不是密度估计)的曲线叠加。

使用一个简单的标准正态示例，下面是一些数据：

x <- rnorm(1000)

我可以这样做：

q <- qplot( x, geom="histogram")
q + stat_function( fun = dnorm )

但这给出了直方图的频率尺度，而不是密度。使用..density..，我可以在直方图上获得适当的比例：

q <- qplot( x,..density.., geom="histogram")
q

但现在这给出了一个错误：

q + stat_function( fun = dnorm )

是不是有什么我没看到的？

另一个问题是，有没有一种方法可以像curve()一样绘制函数的曲线，但不是作为图层？

Answer 1

这就是你要的!

# create some data to work with
x = rnorm(1000);

# overlay histogram, empirical density and normal density
p0 = qplot(x, geom = 'blank') +   
  geom_line(aes(y = ..density.., colour = 'Empirical'), stat = 'density') +  
  stat_function(fun = dnorm, aes(colour = 'Normal')) +                       
  geom_histogram(aes(y = ..density..), alpha = 0.4) +                        
  scale_colour_manual(name = 'Density', values = c('red', 'blue')) + 
  theme(legend.position = c(0.85, 0.85))

print(p0)

Answer 2

Ramnath答案的更基本的替代方案，传递观察到的平均值和标准差，并使用ggplot而不是qplot

df <- data.frame(x = rnorm(1000, 2, 2))

# overlay histogram and normal density
ggplot(df, aes(x)) +
  geom_histogram(aes(y = stat(density))) +
  stat_function(
    fun = dnorm, 
    args = list(mean = mean(df$x), sd = sd(df$x)), 
    lwd = 2, 
    col = 'red'
  )

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Answer 3

如果使用ggplot2中的geom_density()呢？如下所示：

df <- data.frame(x = rnorm(1000, 2, 2))

ggplot(df, aes(x)) +
  geom_histogram(aes(y=..density..)) +  # scale histogram y
  geom_density(col = "red")

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这也适用于多模态分布，例如：

df <- data.frame(x = c(rnorm(1000, 2, 2), rnorm(1000, 12, 2), rnorm(500, -8, 2)))

ggplot(df, aes(x)) +
  geom_histogram(aes(y=..density..)) +  # scale histogram y
  geom_density(col = "red")

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