如何删除由shellfish.py创建的临时.bed文件

Question

我正在运行shellfish.py来执行主成分分析。然而，我在下面得到了这个错误。我该如何解决这个问题？

17:18:39    Found .bed format data data_WTCCC_f_650.bed
17:18:39    Found binary mapfile data_WTCCC_f_650.bim
17:18:39    shellfish error: Trying to create link to original data file data_WTCCC_f_650.bed, but link file shellfish-temp-16297/848716990677.bed already exists, presumably from a previous shellfish run. Delete any such files before running again.

Answer 1

您可以使用以下命令从Python中删除此文件：

import os
os.remove('path/to/bed/file')

当然，您始终可以手动删除此文件。只需在文件资源管理器(或您使用的工具)中找到它并将其删除。