blocks|key|754806|text|如果我还记得的话，您必须从源安装软件包，以便它们能够为R+CMD提供额外的命令。这是因为安装新的R+CMD命令有点麻烦-它需要劫持配置脚本或Makefile，并让它们将文件复制到R文件夹中。从二进制文件安装一个包只会解压一个归档文件，configure和make永远不会运行。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|offset|length|style|CODE|entityRanges|data|754807|所以试试install.packages('roxygen',+type='source')吧。在Windows上，你需要先安装RTools，然后才能工作。|754808|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|http://www.murdoch-sutherland.com/Rtools/^0|R|5|1C|5|39|9|3J|4|0|4|16|1S|6|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|P|8|@$9|Q|A|R|B|C]|$9|S|A|T|B|C]|$9|U|A|V|B|C]|$9|W|A|X|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|F|3|G|5|6|7|Y|8|@$9|Z|A|10|B|C]]|D|@$9|11|A|12|1|13]]|E|$]]|$1|H|3|-4|5|6|7|14|8|@]|D|@]|E|$]]]|I|$J|$5|K|L|M|E|$N|O]]]]

If I recall, you have to install packages from source in order for them to be able to provide additional commands for <code>R CMD</code>. This is because installing new <code>R CMD</code> commands is a bit of a hack---it requires hijacking the configure script or Makefile and having them copy files to the R bin folder. Installing a package from binary simply unpacks an archive, <code>configure</code> and <code>make</code> are never run.

So try <code>install.packages('roxygen', type='source')</code>. On Windows you will need to install the <a href="http://www.murdoch-sutherland.com/Rtools/">RTools</a> before this will work.

blocks|key|978799|text|我前几天才碰到这个。我以管理员的身份安装并修复了它。只需以管理员身份运行R，然后像往常一样执行install.packages，然后重新启动R，因为您并不真的想以管理员身份运行它。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|data|978800|entityMap^0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|D|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|B|3|-4|5|6|7|E|8|@]|9|@]|A|$]]]|C|$]]

I just ran into this the other day. I installed as administrator and that fixed it. Just run R as Administrator then do install.packages as normal, then restart R since you don't really want to run it as administrator.

blocks|key|4538479|text|这是一个我发现在Windows中从命令行操作roxygen2很有用的变通方法。大部分材料都是从here借来的。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|offset|length|style|CODE|entityRanges|data|4538480|创建包含内容的文件roxy.R：|4538481|library(methods)
library(utils)
require(roxygen2)
roxygenize("myPackage")|code-block|syntax|javascript|4538482|(或者您在roxygen中使用的任何参数)。|4538483|然后创建包含内容的批处理文件f.bat：|4538484|Rscript+roxy.R|4538485|然后从命令行运行f：|4538486|>+f|4538487|备注：|4538488|确保Rscript.exe在您的路径中。它通常在像c:\r:\bin\这样的地方找到|4538489|(要在Windows中编辑路径，请右键单击“我的电脑”，然后依次选择“属性”、“高级系统设置”(在左侧菜单上)、“高级”选项卡、“环境变量”按钮、“系统变量”、“路径”。)|4538490|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|https://stackoverflow.com/questions/8964515/cannot-call-roxygenize-function-from-rscript-batch-file/12602559#12602559^0|M|8|1B|4|0|0|9|6|0|0|5|7|0|E|5|0|0|8|1|0|0|0|2|B|P|A|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|1A|8|@$9|1B|A|1C|B|C]]|D|@$9|1D|A|1E|1|1F]]|E|$]]|$1|F|3|G|5|6|7|1G|8|@$9|1H|A|1I|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|H|3|I|5|J|7|1J|8|@]|D|@]|E|$K|L]]|$1|M|3|N|5|6|7|1K|8|@$9|1L|A|1M|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|O|3|P|5|6|7|1N|8|@$9|1O|A|1P|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|Q|3|R|5|J|7|1Q|8|@]|D|@]|E|$K|L]]|$1|S|3|T|5|6|7|1R|8|@$9|1S|A|1T|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|U|3|V|5|J|7|1U|8|@]|D|@]|E|$K|L]]|$1|W|3|X|5|6|7|1V|8|@]|D|@]|E|$]]|$1|Y|3|Z|5|6|7|1W|8|@$9|1X|A|1Y|B|C]|$9|1Z|A|20|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|10|3|11|5|6|7|21|8|@]|D|@]|E|$]]|$1|12|3|-4|5|6|7|22|8|@]|D|@]|E|$]]]|13|$14|$5|15|16|17|E|$18|19]]]]

This is a workaround that I have found to be useful working with <code>roxygen2</code> from the command line (DOS) in Windows. Much of the material is borrowed from <a href="https://stackoverflow.com/questions/8964515/cannot-call-roxygenize-function-from-rscript-batch-file/12602559#12602559">here</a>.

Create file <code>roxy.R</code> with contents:

<pre><code>library(methods)
library(utils)
require(roxygen2)
roxygenize("myPackage")
</code></pre>

(Or whatever arguments you're using with <code>roxygen</code>). 

Then create batch file <code>f.bat</code> with contents:

<pre><code>Rscript roxy.R
</code></pre>

Then run <code>f</code> from the command line:

<pre><code>&gt; f
</code></pre>

Notes:

Make sure <code>Rscript.exe</code> is in your path. It's usually found somewhere like <code>c:\r:\bin\</code>

(To edit the path in Windows, right click 'My Computer', then select 'Properties' then 'Advanced system settings' (on left menu) then 'Advanced' tab, 'Environment Variables' button, 'System variables', 'Path'.)

blocks|key|3070775|text|我在windows上测试过了。R+CMD+%25R_home%25\bin\roxygen.sh起作用了。但是R+CMD+roxygen.sh和R+CMD+roxygen都不能在DOS命令下工作。尽管.sh已关联到sh.exe，并且%25R_home%25\bin\位于系统路径上。与使用R+CMD+INSTALL或install.packages(type='source')按源代码安装相同。|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|offset|length|style|CODE|entityRanges|data|3070776|entityMap^0|F|T|1F|G|1W|D|2O|3|2V|6|34|D|3S|D|46|V|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|H|8|@$9|I|A|J|B|C]|$9|K|A|L|B|C]|$9|M|A|N|B|C]|$9|O|A|P|B|C]|$9|Q|A|R|B|C]|$9|S|A|T|B|C]|$9|U|A|V|B|C]|$9|W|A|X|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|F|3|-4|5|6|7|Y|8|@]|D|@]|E|$]]]|G|$]]

I tested on windows. <code>R CMD %R_home%\bin\roxygen.sh</code> works.
but neither <code>R CMD roxygen.sh</code> nor <code>R CMD roxygen</code> works under DOS command. Although <code>.sh</code> has been associated to <code>sh.exe</code> and <code>%R_home%\bin\</code> is on system path.
Same for installing by source with <code>R CMD INSTALL</code> or <code>install.packages(type='source')</code>.

I just tried out Roxygen package. Within R, I can run through the example in the Roxygen Vignette. But In command line, <code>R CMD roxygen</code> is not recognized as a valid command. When I run <code>R CMD --help</code>, I can see all <code>INSTALL, check, ...sweave..., config...</code> command items but not roxygen. can anyone help me out of this? is there addtional installation steps required other than <code>install.packages("roxygen")</code>? I use windows 32 with R 2.12.0 and working Rtools environments. Thanks.

R CMD roxygen not recognized

翻译质量差，导致语言生硬或混乱。

没有提供实际的解决方法或示例。

解答不清晰，无法理解或解决问题。

页面排版不美观，阅读体验差。

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我刚试过Roxygen套餐。在R中，我可以在Roxygen中遍历示例。但是在命令行中，R CMD roxygen不被识别为有效的命令。当我运行roxygen时，我可以看到所有的INSTALL, check, ...sweave..., config...命令项，但看不到roxygen。有人能帮我解决这个问题吗？除了install.packages("roxygen")之外，还需要执行其他安装步骤吗

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