Linux Makefile:未定义对'gzbuffer‘的引用(其中LIB = -lz)

Question

我正在尝试安装一个程序(vcftools)，它的Makefile代码如下：

# Make file for vcftools
# Author: Adam Auton
# ($Revision: 230 $)

# Compiler
CPP = g++
# Output executable
EXECUTABLE = vcftools
# Flag used to turn on compilation of PCA routines
ifndef VCFTOOLS_PCA
        VCFTOOLS_PCA = 0
endif
# Compiler flags
CPPFLAGS = -O2 -Wall -Wextra -D_FILE_OFFSET_BITS=64
#CPPFLAGS = -g 
# Included libraries (zlib)
#LIB = -lz 
LIB = -lz -I/usr/local/include/ -L/usr/local/lib/


OBJS = vcftools.o vcf_file.o vcf_entry.o \
                vcf_entry_getters.o vcf_entry_setters.o \
                vcf_file_filters.o vcf_file_output.o \
                vcf_file_format_convert.o \
                vcf_file_diff.o parameters.o \
                vcf_file_index.o \
                output_log.o

我无法让这个Makefile正确运行，但却得到了如下错误：

vcf_file.cpp:(.text+0xe72): undefined reference to `gzbuffer'
collect2: ld returned 1 exit status
make[1]: *** [vcftools] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp'
/bin/sh: 2: cd: can't cd to perl
make: *** [install] Error 2

我认为部分问题是与我的zlib安装路径相关的错误。我尝试更改-I和-L路径以匹配我的zlib安装，但没有任何运气(有很多文件夹似乎包含zlib文件)。

此外，通过搜索与此程序(here)相关的其他论坛，似乎我可能需要zlib1g-dev。zlib1g-dev在我的电脑上(它显示在我的ubuntu软件中心)，但当我进入：

root@root:/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp# whereis zlib1g-dev
zlib1g-dev:
root@root:/home/Public/Packages/vcftools_0.1.10/cpp# which zlib1g-dev

我考虑过删除和重新安装zlib，但看起来有几个程序依赖于它。尝试运行安装或删除时，我收到以下消息：

sudo apt-get install zlib-devel

Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
E: Unable to locate package zlib-devel

我不确定问题是不是出在我电脑上zlib的安装位置，是安装中的错误，还是我完全无法理解的其他问题。任何建议都将不胜感激。谢谢。

Answer 1

在我的系统(Ubuntu 12.04.3 LTS)上，这是一个lib位置问题。

确保安装了zlib1g-dev。

在vcftools_cpp/cpp/Makefile中，更改

LIB = -lz

至

LIB = -L/usr/local/lib/ -lz

Answer 2

该区域的obuntu中有一个bug，其中特定库的声明必须出现在库路径的声明之后。

在makefile中，-lz只能放在-L/usr/local/lib/之后

我建议将LIB声明更改为下面的声明-这应该可以解决问题

LIB = -I/usr/local/include/ -L/usr/local/lib/ -lz

Answer 3

我通过搜索对gzbuffer var的未定义引用找到了这一点。在CentOS-6.6Linux机器上从源代码编译ImageMagick时出现错误。我不得不做两件事: 1)按照re的建议。Ubuntu，通过travc，编辑Makefile，查找"LIBS =“(在我的例子中是空白的)，并将其更改为"LIBS = -L/usr/local/lib -lz”。这让我得到了一个干净的编译。运行"make install“来安装它，它在运行时失败了。2)修复方法是cd到/usr/local/lib，然后从命令行运行"ldconfig“。"ldconfig“更新动态链接器运行时绑定(有关详细信息，请参阅"man”页面)。你可以通过在X-windows的命令行中运行“ImageMagick”来确认安装的正常。(如果您安装了ImageMagick，以便“显示”prgm工作，Python及其各种图形/图像生成工具将自动使用它，允许渲染和检查超出屏幕尺寸的复杂图像)。