生物信息学最好的操作系统？

Question

生物信息学工作最好的操作系统是什么？大多数工具是针对64位Windows，还是针对Linux/Unix，还是针对OS X？

Answer 1

一个不错的问题..。生物信息学分析的范围可以从使用现有软件到开发自己的软件。因此，根据你想要完成的任务，你会得到一个不同的答案。然而，Linux可能是您最好的选择，因为大多数生物信息学软件需要从源代码编译，并且很可能是在Linux兼容的平台上开发的。我当前的设置是在VirtualBox中运行Linux的Windows操作系统。通过这种方式，我获得了良好的硬件支持( Linux在某种程度上仍然缺乏)，并且能够使用我的研究所需的大量软件程序。

Answer 2

对于bioinfo来说，Linux是好的，但是你可能需要一些软件来做数据分析。例如，在我的例子中，我必须通过adobe illustrator改进通过脚本生成的矢量图形图像。在这种情况下，一个完整的linux设置对我来说是不好的。

对于服务器和正在运行的程序(主要是perl脚本，因为bioinfo社区喜欢perl)，我强烈支持Linux。任何其他Unix要么已经过时，要么很快就会过时。

因此，我的建议是在服务器上安装Linux，在您的笔记本电脑上安装另一个Unix，以便具有更好的兼容性。由于唯一适用于台式机的Unix解决方案是MacOSX，这就是你问题的答案。

Answer 3

生物信息学仍然是一个严重依赖于文本文件处理的领域，为此Linux提供了许多核心实用程序。一些必备组件包括cat、sed、剪切、粘贴、grep，当然还有预装的perl和python解释器。此外，像R(用于统计计算)这样的软件在Linux中没有内存限制(而在Windows中，出于安全原因，它被限制为可用RAM的一个百分比)。