C++中系统命令的替换错误

Question

我已经写了一个C程序，里面有一些系统命令。我使用一个叫Gromacs的软件。下面是一段C代码：

       #include<stdio.h>
       #include <stdlib.h>

      /*I have removed unnecessary code, which works fine for me. */   

      int main() {

            float LAMBDA=0.37;

            for(LAMBDA=0.37 ; LAMBDA <0.55; LAMBDA +=0.02 ) {

            system("g_bar -f md*.xvg -o -oi -oh");
            system("mapfile -t a < <(g_bar -f md*.xvg -o -oi -oh | sed '/lambda/s/.*DG *//')");

            printf("Free Energy:\t ");
            system("echo ${a[120]}");

       return 0;
     }

我收到一个错误

      sh: 1: Bad substitution

我已经检查了之前关于错误替换的答案。dash似乎不适用于数组，那么我如何为系统命令启用Bash？如果有人能帮我排查故障，我将不胜感激。

Answer 1

sh vs dash vs bash不是问题的根源。

您在第二次调用system()时创建了一个'a‘(不管是什么)。

然后在第四个system()调用中尝试使用这个'a‘。

但这是另一个shell，这里不存在'a‘。

每次调用system()时，都会创建一个新的shell环境，并在返回时消失。

您需要做的是以某种方式将您的'a‘保存到某个文件中，以便后续调用可以处理。

换句话说，每次对system()的调用都像打开了一个新的终端一样，做完自己的事情，然后关闭它。在一个终端(shell会话)中创建的变量在下一个终端中不存在。

编辑：

为了让你相信sh/dash/bash不是你的根本问题，一旦你检查了你的命令在同一个shell会话(终端)中输入时运行正常，你总是可以显式地在你的system()调用中使用bash；

system("bash -c do_my_stuff from_this and_that etc");

Answer 2

首先，mapfile是一个bash4内置命令。system运行sh，而不是bash。

其次，也是错误消息的原因，您在这里使用的是进程替换：

<(g_bar -f md*.xvg -o -oi -oh | sed '/lambda/s/.*DG *//')

sh不支持进程替换。system运行sh，而不是bash。

您有几个对system的调用。您的最后一个调用(如图所示)查看了在前面的shell进程中创建的变量a，它将不再存在！

我建议您编写一个#!/bin/bash脚本，并从C调用该脚本。您可以始终使用fopen和fprintf从C编写该脚本。

如果这不实用，可以按照@jbm建议的方式使用bash -c。但是，除了通过C程序之外，您不能期望跨system调用的持久性。