为论文归档R文件的最佳方法

Question

我快完成我的硕士论文了。在此期间，我得到了很多.R文件。有些只是简单的试错，有些则更严重。我想归档我所有的东西，这样我的评分员就可以访问它们，如果他们愿意，我也可以在将来需要的时候使用它们。请问R中实现这一目标的最佳格式是什么？R项目值得一试吗？谢谢!

Answer 1

这是一个很好的问题，我希望更多的学者能为此做好准备。我推荐将其放在github上，因为这是当今数值计算社区中最常见的代码共享方式。将它包含在你的论文中也是很好的，但老实说，如果它在github上，人们会更容易使用。

分享你所有的东西总比什么都不分享要好，因为人们可以看到你做了什么。如果你有更多的时间让它变得更好，，我建议：

1. Documenting
2. 删除无关的代码并仅保留与论文相关的代码。
3. 针对论文中的每个特定结果，提供生成该结果的特定脚本。如果您有数字，请提供一个脚本来生成准确的数字。

这就是我在学术期刊上发表的论文中用来分析数据的Python代码所做的事情。这样，任何阅读这篇论文的人，如果不清楚这些发现或我是如何生成它们的，都可以查看代码，并确切地了解分析是如何执行的。这是我为此创建的github存储库：https://github.com/cxrodgers/Rodgers2014

为了确保可重复性，最好还记录您使用的模块或软件包(例如，R)的版本，或者甚至将它们复制到您的软件存储库中。