从dbpedia获取InChI/InChIkey

Question

我是DBpedia SPARQL的新手。我想从DBpedia中提取所有的inchikey和inchi。我已经写了下面的查询来做这件事，但由于某些原因它不能工作。

   PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
   PREFIX dbpedia: <http://dbpedia.org/ontology/>

   SELECT * WHERE {
      ?y  a           dbpedia:ChemicalCompound  .
      ?y  rdfs:label  ?Name                     .
      OPTIONAL { ?y dbpedia2:inchi ?inchi }     .
        FILTER ( langMatches(lang(?Name),"en") )
   }

Run Query

它获取name，但没有inchi，并且inchi是ChemicalCompound类的属性。有什么想法吗？

Answer 1

没有多少化合物具有此属性的值。例如，下面的查询计算了该属性的所有三元组，但只有七个：

select (count(distinct *) as ?n) where {
  ?s dbo:inchi ?o
}

SPARQL results (7)

您可以查看哪些值具有此属性：

select ?s ?o where {
  ?s dbo:inchi ?o
}

SPARQL results

因此，您的查询实际上可能会像您预期的那样工作，但您只是在所有没有inchi值的化合物中遗漏了几个inchi值。您可以先对结果进行排序，以查看那些具有inchi值的化合物：

select ?s ?o where {
  ?s a dbo:ChemicalCompound .
  optional { ?s dbo:inchi ?o }
}
order by desc(?o)

SPARQL results