理解带有“jitter”的boxplot

Question

我正在处理一个大型数据集，研究几个地理区域的疾病病例，其中一个预测因素是百里香。我试着创建带有抖动的盒子图，但无法很清楚地解释它。有人能帮上忙吗？

代码如下：

ggplot(factor(Region), Cases, data=orf, geom=c("boxplot", "jitter"),                            
      main=" Cases by Thistles and Regions",fill=factor(Thistles),                          
      xlab="Regions", ylab="Number of cases")

这是一个非常大的数据集，所以这里只是一小部分：

Region  Thistles    Cases
    1   1           40
    1   2           0
    1   1           8
    1   3           73
    1   3           0
    1   1           26
    1   2           0
    1   1           45
    1   4           0
    1   4           22
    1   0           0
    2   3           46
    1   0           10
    2   1           6
    2   1           539
    2   1           0
    2   2           0
    2   1           60
    2   1           0
    2   1           10
    2   3           0
    2   3           29
    3   2           0
    3   4           35
    3   3           100
    3   2           0
    3   1           550
    3   2           0
    3   3           1
    3   5           67
    3   1           0
    3   2           90

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​

Answer 1

这些图表说明了@R RHertel在评论中提出的观点。

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library(ggplot2)

p1 = ggplot(iris, aes(x=Species, y=Sepal.Length)) +
     geom_point(aes(fill=Species), size=5, shape=21, colour="grey20") +
     geom_boxplot(outlier.colour=NA, fill=NA, colour="grey20") +
     labs(title="Not Jittered")


p2 = ggplot(iris, aes(x=Species, y=Sepal.Length)) +
     geom_point(aes(fill=Species), size=5, shape=21, colour="grey20",
                position=position_jitter(width=0.2, height=0.1)) +
     geom_boxplot(outlier.colour=NA, fill=NA, colour="grey20") +
     labs(title="Jittered")

library(gridExtra)
png("jittering.png", height=5, width=10, units="in", res=100)
grid.arrange(p1, p2, nrow=1)
dev.off()