只有当CreateCompatibleStrides用于防止轴的反向迭代时，才能调用Python: RuntimeError: Iterator DONT_NEGATE_STRIDES

Question

嘿，由于某些原因，我可以在LiClipse中运行我的应用程序，但不能从命令行运行完全相同的代码。当执行以下方法时，发生运行时错误。

def truncateOperator(self, v, k):
    """ Performs the truncate operation for a vector in the TPower
    algorithm.
    Inputs:
        v:      The vector to truncate
        k:      The number of elements of the vector to keep
    Outputs:
        u:      The v vector zeroed apart from the k highest elements.
    """
    u = zeros(v.shape[0])
    sortedIndices = argsort(abs(v), axis=0)
    sortedIndices = fliplr(sortedIndices.T).T

    vRestricted = v[sortedIndices[0:k],0]
    normV = 0
    if isinstance(vRestricted, csc_matrix):
        normV = norm(vRestricted.todense())
    else:
        ## Code fails here! ##
        normV = norm(vRestricted)
    if normV == 0:
        return csc_matrix(zeros(v.shape[0]))
    a = array(double(vRestricted))/normV
    u[sortedIndices[0:k]] = a[0:k, 0]
    u = csc_matrix(u)
    return u

错误是:只有在使用DONT_NEGATE_STRIDES阻止轴的反向迭代时，才能调用RuntimeError:迭代器CreateCompatibleStrides

如果有人能帮我解决这个问题，那就太好了。我希望能够从终端运行它。

谢谢，西奥

Answer 1

您已经安装了scipy superpack提供的numpy版本，该版本似乎是使用(或者更确切地说，没有)此DONT_NEGATE_STRIDES编译的。

我会提出两个可能的建议：

• 将此错误作为问题报告到scipy superpack issue page上的问题跟踪器中。他们可能会帮助你解决this.
• alternatively，删除这个包(可能还有其他安装的scipy superpack包)。您可以只从site-packages目录中删除完整的*.egg目录。然后，使用pip：sudo pip install numpy再次安装numpy。对之前从scipy superpack获得的其他必需软件包(例如，scipy、pandas等)执行相同的操作。这可能需要一段时间，因为它将在您的系统上编译(即，您没有下载二进制文件)。这需要安装XCode及其命令行工具(主要是gcc/clang)。

我自己的首选替代方案是使用homebrew来安装最新的Python版本(因此不使用system python)，并使用相应的pip来安装所有必需的包(这避免了像现在这样将东西放在/System和/Library中)。

最后，还有一个不需要删除或安装新东西的变通方法，尽管我不直接推荐它，因为它会在将来以某种方式伤害您:使用PYTHONPATH：设置您的PYTHONPATH在命令行中指向LiClipse包：

$ export PYTHONPATH=/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python

这将把LiClipse包路径放在要找到的第一个位置，在scipy superpack包之前。