我正在尝试通过多处理使用类方法来并行化代码。基本结构如下:
# from multiprocessing import Pool
from pathos.multiprocessing import ProcessingPool as Pool
class myclass(object):
def __init__(self):
#some code
def mymethod(self):
#more code
return another_instance_of_myclass
def myfunc(myinstance,args):
#some code
test=myinstance.mymethod()
#more code
return myresult #not an instance,just a number
p=Pool()
result = p.map(myfunc,listwithdata)在正常的多处理失败后,我意识到了Pickle和多处理的问题,所以我尝试用multiprocessing.pathos来解决它。然而,我还是得到了
PicklingError: Can't pickle <type 'SwigPyObject'>: it's not found as__builtin__.SwigPyObjec同时还有很多来自pickle.py的错误。除了这个实际问题之外,我不太理解为什么除了myfunc的最终结果之外,其他任何东西都会被浸泡。
发布于 2015-03-19 01:42:47
pathos使用dill,dill序列化类的方式与python的pickle模块不同。pickle通过引用来序列化类。dill (默认情况下)直接序列化类,并且只能选择性地通过引用来序列化。
>>> import dill
>>>
>>> class Foo(object):
... def __init__(self, x):
... self.x = x
... def bar(self, y):
... return self.x + y * z
... z = 1
...
>>> f = Foo(2)
>>>
>>> dill.dumps(f) # the dill default, explicitly serialize a class
'\x80\x02cdill.dill\n_create_type\nq\x00(cdill.dill\n_load_type\nq\x01U\x08TypeTypeq\x02\x85q\x03Rq\x04U\x03Fooq\x05h\x01U\nObjectTypeq\x06\x85q\x07Rq\x08\x85q\t}q\n(U\r__slotnames__q\x0b]q\x0cU\n__module__q\rU\x08__main__q\x0eU\x03barq\x0fcdill.dill\n_create_function\nq\x10(cdill.dill\n_unmarshal\nq\x11Uyc\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00C\x00\x00\x00s\x0f\x00\x00\x00|\x00\x00j\x00\x00|\x01\x00t\x01\x00\x14\x17S(\x01\x00\x00\x00N(\x02\x00\x00\x00t\x01\x00\x00\x00xt\x01\x00\x00\x00z(\x02\x00\x00\x00t\x04\x00\x00\x00selft\x01\x00\x00\x00y(\x00\x00\x00\x00(\x00\x00\x00\x00s\x07\x00\x00\x00<stdin>t\x03\x00\x00\x00bar\x04\x00\x00\x00s\x02\x00\x00\x00\x00\x01q\x12\x85q\x13Rq\x14c__builtin__\n__main__\nh\x0fNN}q\x15tq\x16Rq\x17U\x01zq\x18K\x01U\x07__doc__q\x19NU\x08__init__q\x1ah\x10(h\x11Uuc\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00C\x00\x00\x00s\r\x00\x00\x00|\x01\x00|\x00\x00_\x00\x00d\x00\x00S(\x01\x00\x00\x00N(\x01\x00\x00\x00t\x01\x00\x00\x00x(\x02\x00\x00\x00t\x04\x00\x00\x00selfR\x00\x00\x00\x00(\x00\x00\x00\x00(\x00\x00\x00\x00s\x07\x00\x00\x00<stdin>t\x08\x00\x00\x00__init__\x02\x00\x00\x00s\x02\x00\x00\x00\x00\x01q\x1b\x85q\x1cRq\x1dc__builtin__\n__main__\nh\x1aNN}q\x1etq\x1fRq utq!Rq")\x81q#}q$U\x01xq%K\x02sb.'
>>> dill.dumps(f, byref=True) # the pickle default, serialize by reference
'\x80\x02c__main__\nFoo\nq\x00)\x81q\x01}q\x02U\x01xq\x03K\x02sb.'不按引用序列化要灵活得多。然而,在极少数情况下,使用引用会更好(就像在SwigPyObject上构建的东西一样)。
我的意思是(大约2年来)将byref标志暴露给pathos内部的dump调用,但还没有这样做。这样做应该是一个相当简单的编辑。我刚刚添加了一个这样做的票据:https://github.com/uqfoundation/pathos/issues/58。在此期间,打开pathos使用…的dump和load函数的替代品也应该很容易这样,您就可以使用定制的序列化程序(例如,扩展dill提供的序列化程序,或者使用其他序列化程序)。
发布于 2015-03-18 21:14:17
在多进程处理中,进程间通信需要序列化函数。Pickle在这方面做得很差,可以通过pip安装dill。详细信息(带有一个很好的“星际迷航”示例)可以在这里找到:http://matthewrocklin.com/blog/work/2013/12/05/Parallelism-and-Serialization/
https://stackoverflow.com/questions/29121979
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