是否存在用于读取HDF5文件的纯python包？

Question

h5py包需要安装libhdf5-dev (在Debian系统上)。这是一个问题，因为我在一些需要读取HDF5文件的系统上没有超级用户权限。

有没有Python包可以不需要非Python包来读取(非常简单的) HDF5文件？

Answer 1

据我所知，没有这样的套餐。但您不需要在整个系统范围内安装libhdf5。只需在主目录中的某个位置安装/编译它，然后告诉h5py它在哪里：$HDF5DIR=/path/to/libhdf5pip install h5py

详细信息请参阅手册：http://docs.h5py.org/en/latest/build.html

Answer 2

我没有足够的声誉来评论，所以我不得不在这里写我的评论。您可以在您的主目录中安装整个python堆栈。这样，您就可以完全控制python安装。

我使用的是anaconda python，它是随h5py一起提供的，我将它安装在我的主目录中。我可以安装任何我想要的包，或者在我想要的时候更新它们。例如，许多包最近看到了许多改进，包括稳定性的改进。