R数据中心的CPU利用率热图

Question

我从数据中心的100台服务器上得到了数据。读数是具有3列Time、host name、CPU Utilization的时间的数据帧格式。读数是由监测系统每10分钟产生一次。我需要绘制一个CPU使用率的热图，在热图中使用time在X轴上，% of servers在Y轴上，CPU utilization范围。

例如:如果服务器总数为5。输入数据如下

Time            CPU Hostname
1/25/2015 10:15  19%    H1
1/25/2015 10:15  90%    H2
1/25/2015 10:15  90%    H3
1/25/2015 10:15  50%    H4
1/25/2015 10:15  25%    H5
1/25/2015 10:25  30%    H1
1/25/2015 10:25  85%    H2
1/25/2015 10:25  30%    H3
1/25/2015 10:25  21%    H4
1/25/2015 10:25  21%    H5

所需的输出是一个堆叠图，用于在热图中描述以下图形。

例如，在10:15中，2服务器处于80-100%利用率范围内，因此值为40%

Range   10:15   10:25
0-20    20%      0%
20-40   20%      80%
40-60   20%      0%
60-80   0%       0%
80-100  40%      20%

需要关于R中的函数的帮助来绘制这种热图。我尝试过使用xts，但我不清楚如何应用xts包的用例。

Answer 1

你只需要：

将值放入您需要的组中查找%

• cut group
• expand
• geom_tile

your heatmap

以下代码的许多组件都在许多SO帖子中：

library(dplyr)
library(ggplot2)
library(tidyr)
library(scales)

dat <- read.table(text="Time,CPU,Hostname
1/25/2015 10:15,19%,H1
1/25/2015 10:15,90%,H2
1/25/2015 10:15,90%,H3
1/25/2015 10:15,50%,H4
1/25/2015 10:15,25%,H5
1/25/2015 10:25,30%,H1
1/25/2015 10:25,85%,H2
1/25/2015 10:25,30%,H3
1/25/2015 10:25,21%,H4
1/25/2015 10:25,21%,H5", header=TRUE, sep=",", stringsAs=FALSE)


total_hosts <-length(unique(dat$Hostname))

dat %>%
  mutate(Time=as.POSIXct(Time, format="%m/%d/%Y %H:%M"),
         Day=format(Time, format="%Y-%m-%d"),
         HM=format(Time, format="%H:%M"),
         CPU=as.numeric(gsub("%", "", CPU)),
         `CPU Range`=as.character(cut(CPU, 
                                breaks=c(0,20,40,60,80,100), 
                                labels=c("0-20", "20-40", "40-60", 
                                         "60-80", "80-100")))) %>%
  group_by(Day, `CPU Range`, HM) %>%
  summarise(Pct=n()/total_hosts) %>%
  merge(expand(., `CPU Range`, HM, Day), all.y=TRUE) -> dat

gg <- ggplot(dat, aes(x=HM, y=`CPU Range`))
gg <- gg + geom_tile(aes(fill=Pct), color="#7f7f7f")
gg <- gg + scale_fill_distiller(palette="RdPu", na.value="white", 
                                label=percent, name="% Hosts")
gg <- gg + coord_equal()
gg <- gg + labs(x=NULL)
gg <- gg + theme_bw()
gg <- gg + theme(panel.border=element_blank())
gg <- gg + theme(panel.grid=element_blank())
gg

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​

我将Day留在了数据框中，以防您想要/需要通过它进行facet_wrap或聚合。