这是一个与在R中求解微分方程(DE)相关的非常基本的问题:
我正在使用deSolve包来求解DE。
dX <- a*X + a*b
问题是我想在时间(基于我的时间列)和相应的b值(b值在每次都不同)上评估解决方案。
下面是我的代码:
parameters <- c(a=1.3714)
state <- c(X=0)
Lorenz <- function(t, state, parameters) {
with(as.list(c(state, parameters)), {
# rate of change
b <- c(PD$blood)
dX <- a*X + a*b
# return the rate of change
list(dX)
})
}
times <- PD$time
head(times)
library(deSolve)
out <- ode(y = state, times = times, func = Lorenz, parms = parameters)发布于 2015-01-14 12:25:27
我不确定我是否完全理解了这个问题,提供一些示例数据可能会有所帮助,但您可以定义一个函数(fun_dyn_b),该函数在时间t调用Lorenz函数中定义的b值:
parameters <- c(a=1.3714)
state <- c(X=0)
func_dyn_b <- function(t) PD$blood[t]
Lorenz <- function(t, state, parameters) {
with(as.list(c(state, parameters)), {
# rate of change
b <- func_dyn_b(t)
dX <- a*X + a*b
# return the rate of change
list(dX)
})
}
times <- PD$time
head(times)
library(deSolve)
out <- ode(y = state, times = times, func = Lorenz, parms = parameters)希望这能有所帮助。
看起来您的时间间隔不均匀,因此我的解决方案不起作用,因为时间需要以1为增量,从1开始(因此它可以用作索引)。我建议多看看你的时间间隔,看看你是否能弄清楚确切的时间间隔(0.0033秒)。或者其他什么?)并考虑一种实现func_dyn_b()的方法,这样它就可以在正确的时间调用正确的b。
祝好运。
https://stackoverflow.com/questions/27935140
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