使用R语言读取多个PDB文件？

Question

R语言对单个蛋白质使用read.pdb文件。

p= read.pdb(D:/R/1XYZ.pdb)

我想让R从文件夹中读取多个pdb文件，然后将其存储。有没有相应的代码？

Answer 1

如果您希望将文件存储在一个变量中，以下内容可能会对您有所帮助。如果您没有在.pdb文件所在的文件夹中运行R，下面使用的list.files函数也可以接受'path‘参数。

pdbfiles <- list.files(pattern="*.pdb", full.names=TRUE) # Rerieving .pdb files
pdb <- lapply(pdbfiles, read.pdb) # Apply the 'read.pdb' function on each file

我希望它能对你有所帮助。

Answer 2

只需添加一个tidyverse答案：

library(tidyverse)

df <- list.files(pattern = ".pdb") %>%
  map(read.pdb) %>% 
  bind_rows()