有没有可能在ImageJ中实现“全景多维堆栈”？

Question

我正在做免疫组织化学，我有两个不同的信号，我想做细胞计数。

我的想法是在二维(标记1，标记2)中使用z堆栈(20帧)。这对我来说对于一个图像来说是没有问题的。但是，我看到的区域很大，我想使用高倍率，所以我想将不同的图像组合成一个非常大的图像，这两个标记也是z堆叠的。

这可以做到吗?有什么建议吗？

编辑:另外，需要注意的是，我没有配备电动工作台的共焦显微镜，只有没有电动工作台的常规荧光显微镜。

谢谢，普拉兹

Answer 1

只要您的图像包含大量重叠(不需要电动舞台，只需确保两个相邻的图像在其边界共享一些视觉特征)，您就可以使用Fiji附带的Stitching插件：

• 插件>缝合>网格/集合缝合
• 在第一个对话框中，选择类型:未知位置

如果不同的z级别和颜色通道位于不同的文件中，则可能需要将它们合并到超级堆栈中(图像>颜色>合并通道...)首先，在缝合之前。