使用awk打印三列，然后设置三列

Question

我想从一个大得多的文件中创建多个文件，按列划分。例如，我的较大文件的标题如下所示：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C SNP2A SNP2B SNP2C SNP3A SNP3B SNP3C

我想创建这些文件：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C

我一直在尝试使用awk，但我还是个新手，所以我的命令现在是这样的：

for ((i=1; i<=440;i++)); do awk -f printindivs.awk inputfile done

其中printindivs.awk是：{print $1 $2 $3 $((3*$i)+1) $((3*$i)+2) $((3*$i)+3))}

我得到的输出表明，我尝试获取三个集合的方法是错误的:我该如何做到这一点？

谢谢

Answer 1

只需一个简单的awk脚本即可轻松完成此操作：

$ awk '{for(i=4;i<=NF;i+=3)print $1,$2,$3,$i,$(i+1),$(i+2) > ("out"++j)}' file

输出文件将采用out[1..n]格式

$ cat out1
Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

$ cat out2
Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

$ cat out3
Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C