在200+化学反应库中遍历的有效搜索机制是什么

Question

我目前正在开发一种有机转化模拟器，当提供起始化合物和结束化合物时，它将有助于生成转化的中间步骤。我正在寻找一种搜索机制来获得中间化合物。我偶然发现了Brute force作为搜索的解决方案。但由于我的库中有大约200个反应来检查每个化合物，我认为这将导致大量的时间消耗。有哪些其他的技术或算法可以减少我的时间消耗，以有效地完成我的需求。例如，我有模糊逻辑、遗传算法等

Answer 1

关于遗传算法，它是一个很好的多参数优化工具。但是，当然，你需要评估每个反应的动力学参数，而不仅仅是反应机理框架。此外，每个中间物种都需要热力学数据。因此，你有大量的参数--你需要大量的实验数据来正确评估这些参数。如果你已经有了自己的反应集，你可以生成完整的动力学机制(包括所有的路径)，并进一步实现化学机制的简化技术。有不同的缩减技术，不是用来讨论堆栈溢出的。此外，如果你的反应参数被估计了(这样反应就可以处理了)，你可以用GA生成不同的方案-例如，用二元基因-0-这个反应不会被包括在方案中，1-将被包括在内。