如何在关闭文件后将h5py组保留在内存中？

Question

如何在关闭文件后将h5py组保留在内存中？

在以下代码之后：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"]

我可以访问worm_features，因为它是一个h5py group (<HDF5 group "/worm" (4 members)>)

但在我运行这行代码之后：

feature_file.close()

我无法再访问worm_features。它现在显示为<Closed HDF5 group>。

因为我需要加载大约20个文件的worm_features h5py组，所以我想在处理加载到内存中的数据之前关闭这些文件。这是不可能的吗？

Answer 1

使用.value从数据集中提取所需的变量。

示例：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"].value
feature_file.close()
print worm_features

Answer 2

关闭hdf5文件后，使用[:]将dataset的值复制到变量，以便能够访问dataset。

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"] [:]
feature_file.close()
print (worm_features)

.value不适用于我，并引发以下错误：

AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'