我正在寻找用于生物信息学CGH分析的python模块。我找到了一些工具,但它们是基于web的,我没有在python中找到任何处理CGH分析的模块,也没有处理所有的图形。
我想要python中的命令行模块。
如果有人知道这件事,请让我知道。
谢谢
发布于 2013-02-23 09:15:55
我怀疑你会找到一个。如果您正在执行数组工作,并且希望通过命令行来驱动它,那么学习一些R,并从众多包中选择一个用于CGH分析。我相信有一些python/R绑定可以帮助您。
http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html
http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html
http://www.hindawi.com/journals/cfg/2009/201325/
https://stackoverflow.com/questions/15028340
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