尝试导入skbio模块时找不到future.utils.six

Question

我刚刚用pip3安装了numpy和scikit bio。如果我在交互式会话中导入DNASequence，则会收到一条错误消息：

>>> from skbio.sequence import DNASequence
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/__init__.py", line 64, in <module>
    from skbio.stats.distance import DistanceMatrix
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/stats/distance/__init__.py", line 293, in <module>
    from ._base import (DissimilarityMatrixError, DistanceMatrixError,
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/stats/distance/_base.py", line 11, in <module>
    from future.utils.six import StringIO, string_types
ImportError: No module named 'future.utils.six'

运行'pip3 list‘显示安装了six 1.8.0。更奇怪的是，如果我重复执行import语句，DNASequence就会正确加载。你知道是什么导致了这种行为吗？

我运行的是MacOSX10.9.5 (Mavericks)，Python 3.4.1 (通过自制软件安装)。

Answer 1

这是0.14.0版中对future包的更改(删除了future.utils.six，如here所示)的一个问题。

我们已经在scikit-bio的开发版本中修复了这个问题，但在此期间，您可以将其重新用于发布版本，如下所示：

pip uninstall future pip install future==0.13.1

如果你感兴趣，请访问here了解更多关于这个问题的讨论。