为Ontology individuals @Jena添加基本价值

Question

我有一个本体论与一些类和所有设置运行。用个人和数据填充它的好方法是什么？简而言之，执行从数据库(作为输入)到本体的单向映射。

public class Main {

static String SOURCE =  "http://www.umingo.de/ontology/bento.owl";

static String NS =  SOURCE+"#";

 public static void main(String[] args) throws Exception {
    OntModel model = ModelFactory.createOntologyModel( OntModelSpec.OWL_MEM );

    // read the RDF/XML file
    model.read(SOURCE);

    OntologyPreLoader loader = new OntologyPreLoader();
    model = loader.init(model);

    model.write(System.out,"RDF/XML");

 }
}

我的预加载器有一个方法init，目的是将数据从数据库复制到本体中。以下是摘录。

 public OntModel init(OntModel model) throws SQLException{

          Resource r = model.getResource( Main.NS + "Tag" );
          Property tag_name = model.createProperty(Main.NS + "Tag_Name");
          OntClass tag = r.as( OntClass.class );
          // statements allow to issue SQL queries to the database
          statement = connect.createStatement();
          // resultSet gets the result of the SQL query
          resultSet = statement
              .executeQuery("select * from niuu.tags");
            // resultSet is initialised before the first data set
            while (resultSet.next()) {
              // it is possible to get the columns via name
              // also possible to get the columns via the column number
              // which starts at 1
              // e.g., resultSet.getSTring(2);
              String id = resultSet.getString("id");
              String name = resultSet.getString("name");

              Individual tag_tmp = tag.createIndividual(Main.NS+"Tag_"+id);
              tag_tmp.addProperty(tag_name,name);
              System.out.println("id: " + id);
              System.out.println("name: " + name);
            }

          return model;
      }

一切都在运行，但我对这种预加载本体的方式感到非常不确定。此外，每个人都应该获得自己的ID，以便我可以在以后将其与数据库进行匹配。我可以简单地定义一个属性ID并将其添加到每个人吗？

我考虑将ID添加到"Thing“中，因为它是OWL本体中最基本的类型。

Answer 1

乍一看，这似乎还可以。一个技巧是尝试将Jena模型转换为RDF序列化，并通过Protégé运行它，以便更清楚地了解您的本体映射是什么样子。

您绝对可以创建自己的属性来描述每个人的id。下面是一个示例，说明如何以turtle格式创建类似的属性。(我没有添加OWL和rdfs的前缀，因为它们很常见)如果需要，也可以在Jena中添加。(或者将其加载到Jena中的模型中。)

@prefix you: <your domain> .
you:dbIdentificator a owl:DatatypeProperty  .
you:dbIdentificator rdfs:label "<Your database identifcator>"@en  .
you:dbIdentificator rdfs:comment "<Some valuable information if needed>"@en  .
you:dbIdentificator rdfs:isDefinedBy <your domain>  .
you:dbIdentificator rdfs:domain owl:Thing  .

您还可以将owl:Thing添加到每个资源，但这不是最佳实践，因为它是资源的模糊定义。我会四处寻找定义资源是什么的词汇表。看看GoodRelations吧。它是一个非常好定义的词汇表，可以描述信息，即使它不是用于商业用途。尤其是查看那里的类。

希望这回答了你的一些问题。

Answer 2

以编程方式生成URI总是有些令人不安。如果您有Guava，那么可以使用Preconditions对数据库中的内容做出一些快速失败的断言(这样，如果代码与您的模式不一致，就会让您知道)。使用JDK来确保从数据库获得的URLEncoder被转换成URI友好的格式(请注意，如果您的数据包含不能用id打印的字符，并且没有百分号编码，则需要手动处理它们)。

对于属性/列值，请使用显式创建文字。这清楚地表明您使用的是纯文字、语言文字还是类型文字：

// If things can have multiple names in multiple languages, for example
tag_tmp.addProperty(tag_name,model.createTypedLiteral(name, "en"));

请注意，您可能不希望定义您的模式，使其隐含有关owl:Thing的内容，因为这将在您的域之外产生影响。相反，应该定义一个特定于域的概念，比如:DatabaseResource。将属性域设置为该属性域，它是子类而不是事物。这样，使用您的属性意味着主题与您的域中的owl个体，而不是简单的owl个体(不管怎样，由owl:DatatypeProperty的域暗示)。

RDF :创建数据库惟一ID的表示并将其放入模型中是完全可以接受的。如果您使用的是owl2，则可以在该属性上为:DatabaseResource定义一个OWL-2 Key，并保留与数据库中相同的语义。

编辑：在Jena邮件列表中记录您的帖子的一部分：

我有一个巨大的MYSQL数据库，只读的目的，并想提取一些数据到本体论。

我强烈建议使用TDB Java API来构建一个由您的磁盘支持的Dataset。我以前处理过非常大的数据库导出，否则您的数据大小很可能不容易处理。TDB的索引需要大量的磁盘空间，但是由于OOM错误，内存映射的IO使得终止操作非常困难。最后，一旦在磁盘上构建了数据库，就不必再次执行这个代价高昂的导入操作(或者至少可以对其进行优化)。

如果您发现创建数据库的时间太长，那么您可以创造性地使用批量加载器。This answer有一个使用java的批量加载器的例子。